[发明专利]用于肠道病毒CoxB5的RT-LAMP检测试剂盒有效
申请号: | 201410405707.0 | 申请日: | 2014-08-18 |
公开(公告)号: | CN104152587A | 公开(公告)日: | 2014-11-19 |
发明(设计)人: | 黄学勇;李幸乐;胡小宁;马红霞;杜燕华;马宏;许汴利;刘国华 | 申请(专利权)人: | 河南省疾病预防控制中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 郑州异开专利事务所(普通合伙) 41114 | 代理人: | 王霞 |
地址: | 450016 河南*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 肠道病毒 coxb5 rt lamp 检测 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及分子生物学技术领域,尤其是涉及一种用于实验室诊断肠道病毒CoxB5的RT-LAMP检测试剂盒。
背景技术
研究显示,肠道病毒是导致病毒性脑炎爆发的主要病毒,全球各地每年都有肠道病毒导致的病毒性脑炎发生,在希腊、韩国、斯洛伐克、台湾地区、香港地区、印度和中国大陆均有发生,血清型各不相同。2006年,河南省信阳市爆发了一起由肠道病毒CoxB5(柯萨奇B5)引起的病毒性脑炎。在随后的2010年和2011年连续两年,平顶山市和漯河市又分别爆发了一起由肠道病毒CoxB5引起的病毒性脑炎。2013年,在河南省安阳市也爆发了一起由肠道病毒CoxB5引起的病毒性脑炎。种种现象表明,肠道病毒CoxB5在河南省已经形成一定的规模,逐渐呈现出一种长期的、大范围流行的趋势。
肠道病毒CoxB5的感染者轻者可致低烧,重者可出现小儿麻痹、脑炎、心肌炎和呼吸衰竭等等。人类对肠道病毒CoxB5普遍易感,而且目前肠道病毒CoxB5既没有常规监测,也没有常规计划免疫提供。鉴于这样的流行趋势、临床表现和免疫现状,肠道病毒CoxB5可能会成为河南省一个新的突发公共卫生事件的热点。但针对这种严重的现状,现有的检测方法却费时费力,成本高昂,不能满足现场快速诊断的需求。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于肠道病毒CoxB5的RT-LAMP检测试剂盒,本试剂盒能够快速、简便、敏感、特意的检测病毒性脑炎患者中的肠道病毒CoxB5,为突发公共卫生事件的处理提供准确的实验室诊断依据。
为实现上述目的,本发明可采取下述技术方案:
本发明所述的用于肠道病毒CoxB5的RT-LAMP检测试剂盒,包括六种反应引物,所述六种反应引物依次为:
FIP:GTTGGTGGACGTCTGCCAGCGGTGCCCACGAAAGTGAA;
F3:TGTATGTGCCCCCAGGT;
BIP:AAGACATGGGTCCCAAGACCACTTCTGGTACTGGCACAACCT;
B3:TCAGTCACGCCAGTAGGTT;
F1C:GTTGGTGGACGTCTGCCAGC;
B1C:AAGACATGGGTCCCAAGACCAC。
所述反应引物FIP是基于肠道病毒CoxB5 VP1基因3' 端的F2c和Flc区设计而成,由F2区和F1C区组成,F2区与F2c区互补,F1C区与Flc区序列相同;所述反应引物F3是基于肠道病毒CoxB5 VP1基因3' 端的F3c区设计而成,与F3c区互补;所述反应引物BIP 是基于肠道病毒CoxB5 VP1基因5' 端的Bl和B2区设计而成,由B1C和B2区组成,B1C区与Blc区序列互补,B2区与B2区序列相同;所述反应引物B3是基于肠道病毒CoxB5 VP1基因5' 端的B3区设计而成,和B3c区互补;所述反应引物FIC和BIC是分别基于肠道病毒CoxB5 VP1基因3' 端的F2c区和5’端的B2区设计而成,分别与F2c区和B2区互补。
LAMP针对肠道病毒CoxB5 VP1基因设计引物,肠道病毒VP1区段是肠道病毒中和抗原位点主要所在区域,也是肠道病毒基因型别的决定区域。针对该区域设计的引物保证了检测的特异度。同时,LAMP引物的设计主要是基于肠道病毒CoxB5 VP1基因区域3’端的F3c、F2c和Flc区以及5' 端的Bl、B2和B3区等六个不同的位点设计的六种引物。
本发明的优点主要体现在以下几点:
1、灵敏度高:测试结果显示,肠道病毒CoxB5的RT-LAMP检测试剂盒的灵敏度比传统的RT-PCR方法高2~5个数量级;
2、特异性好:本发明以肠道病毒CoxB5标准株、肠道病毒CoxB5河南省标准株和肠道病毒CoxB5型河南省流行株为模板,针对肠道病毒CoxB5型VP1区设计引物,引物特异性好、准确性高;
3、简便安全:操作简单、安全,无需专门的仪器设备,结果可直接通过肉眼观察;
4、快速直观:速度快,可在30~60min内完成,比PCR节约至少60min。
附图说明
图1是本发明的工作原理图。
图2是RT-LAMP的特异性结果图。
图3是RT-LAMP的敏感性结果图。
具体实施方式
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