[发明专利]DNA甲基转移酶3α基因位点分型检测方法及检测试剂盒无效
申请号: | 201410265682.9 | 申请日: | 2014-06-13 |
公开(公告)号: | CN103993099A | 公开(公告)日: | 2014-08-20 |
发明(设计)人: | 祁小飞 | 申请(专利权)人: | 苏州大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙) 32257 | 代理人: | 杨明 |
地址: | 215123 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dna 甲基转移酶 基因 位点分型 检测 方法 试剂盒 | ||
1.一种DNA甲基转移酶3α基因位点分型检测方法,其特征在于,该方法包括如下步骤:
以基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到PCR的扩增产物;
对PCR的扩增产物进行LDR扩增,得到LDR的扩增产物;
对LDR的扩增产物进行分析,判断各耐药位点的基因型。
2.根据权利要求1所述的DNA甲基转移酶3α基因位点分型检测方法,其特征在于,所述PCR扩增时的引物为一对正向引物和反向引物。
3.根据权利要求2所述的DNA甲基转移酶3α基因位点分型检测方法,其特征在于,所述正向引物序列为:5’-TCCTGCTGTGTGGTTAGACG-3’;
所述反向引物序列为:5’-CCATGTCCCTTACACACACG-3’。
4.根据权利要求1所述的DNA甲基转移酶3α基因位点分型检测方法,其特征在于,所述LDR扩增时采用的探针为荧光标记探针和检测探针。
5.根据权利要求4所述的DNA甲基转移酶3α基因位点分型检测方法,其特征在于,所述荧光标记探针的荧光基团为5-FAM、6-FAM、TAMRA、HEX、TET、JOE、VIC、NED、ROX、D1、D2、D3或D4。
6.一种DNA甲基转移酶3α基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述检测试剂盒由如下三部分组成:PCR试剂、LDR试剂和标准品。
7.根据权利要求6所述的DNA甲基转移酶3α基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述PCR试剂包含一对正向引物和反向引物、双蒸水、聚合酶、聚合酶配套缓冲液、dNTP与镁离子,
其中,聚合酶为Taq酶,镁离子由MgCl2提供。
8.根据权利要求6所述的DNA甲基转移酶3α基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述LDR试剂包含相关位点的荧光探针、双蒸水、Taq连接酶和连接酶配套缓冲液。
9. 根据权利要求6所述的DNA甲基转移酶3α基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述标准品为野生型质粒DNA。
10.根据权利要求7所述的DNA甲基转移酶3α基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述正向引物序列为:5’-TCCTGCTGTGTGGTTAGACG-3’;所述反向引物序列为:5’-CCATGTCCCTTACACACACG-3’。
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