[发明专利]用于预测患2型糖尿病肾病发生风险的标记物及其用途有效
申请号: | 201410254863.1 | 申请日: | 2014-06-10 |
公开(公告)号: | CN103981280A | 公开(公告)日: | 2014-08-13 |
发明(设计)人: | 李志国;沈宏;刘业强;马丽梅;蒲志杰;杨向军 | 申请(专利权)人: | 河北联合大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京爱普纳杰专利代理事务所(特殊普通合伙) 11419 | 代理人: | 王玉松 |
地址: | 063009 *** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 预测 糖尿病肾病 发生 风险 标记 及其 用途 | ||
技术领域
本发明涉及分子生物学和医学领域,特别涉及一种用于预测患2型糖尿病肾病发生风险的标记物及其用途。
背景技术
糖尿病是一种糖、蛋白质、脂肪代谢障碍的慢性综合征,继发于胰岛素分泌不足,或靶组织产生抗胰岛素性;有两种主要型:胰岛素依赖性糖尿病(1型)和非胰岛素依赖性糖尿病(2型)。
2型糖尿病(type2diabetesmellitus,T2DM)的发病受到环境和基因双重因素的影响。遗传因素能增加机体发生2型糖尿病的危险性。目前T2DM的发病率在所有种族和年龄段均逐渐上升。虽然进行了大量的基因组关联分析,但是大部分T2DM相关基因仍然未知。
2型糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)是T2DM的一个常见并发症,其发展也受到环境和基因双重因素的影响;DN能导致T2DM患者终末期肾病;是成人慢性肾功能衰竭病首要原因;也是糖尿病患者发病和致死的主要原因。所以当务之急是研究DN的易感基因,以此来预测2型糖尿病肾病的发生风险及开展针对此基因的药物治疗;目前一些基因组扫描(genome-wide scans,GWS)和相关性研究已经发现一些基因与DN密切相关,但是DN发生的所有易感基因并未完全明确。因此为了研究2型糖尿病肾病及其发病机制,预测患2型糖尿病肾病的发生风险,需要生物学家及医学家更多的发现2型糖尿病肾病的相关基因。
发明内容
为了解决上述技术问题,本发明提供一个新的能预测患2型糖尿病肾病发生风险的标记物。
本发明具体技术方案如下:
本发明提供一种用于预测人患2型糖尿病肾病发生风险的标记物,该述标记物为人类基因组编号为rs3733570的SNP(single nucleotidepolymorphism)位点的基因型,该SNP位点的基因型的存在标志着患2型糖尿病肾病的发生风险。
rs3733570的相关信息可从http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?rs=3733570中找到依据。
进一步的改进,所述SNP位点的基因型为rs3733570的基因型。
进一步的改进,所述rs3733570的T等位基因的存在标志着患2型糖尿病肾病的发生风险增高。
进一步的改进,所述rs3733570的T/T基因型的存在标志着患2型糖尿病肾病的发生风险增高。
进一步的改进,所述rs3733570的共显性中C/T和T/T基因型的存在,或显性中C/T和T/T基因型的存在,或隐性中T/T基因型的存在标志着患2型糖尿病肾病的发生风险增高。
进一步的改进,所述共显性中T/T基因型患2型糖尿病肾病的发生风险是C/C基因型的7-8倍;C/T基因型患2型糖尿病肾病的发生风险是C/C基因型的3-4倍;显性中C/T和T/T基因型患2型糖尿病肾病的发生风险是C/C基因型的4-5倍;隐性中T/T基因型患2型糖尿病肾病的发生风险是C/C和C/T基因型的3-4倍。
进一步的改进,所述标记物在用作预测患2型糖尿病肾病发生风险的试剂中的应用。
本发明所述2型糖尿病肾病患者为亚洲人。
本发明另一方面提供了识别标记物的方法,该标记物的存在标志着患2型糖尿病肾病的发生风险,该方法包括如下步骤:
a.收取EDTA-K2抗凝静脉全血;
b.通过全血PCR扩增体系扩增rs3733570所在外显子片段;
c.将b步骤获得的PCR产物纯化;
d.将步骤c得到的纯化产物,经测序仪(3730xl,ABI)测序;
e.分析结果。
进一步的改进,所述扩增步骤包括:94℃3分钟,55℃3分钟循环4次;94℃变性5分钟后进入循环,94℃变性30秒,52℃退火30秒,72℃延伸90秒,40个周期后,72℃延伸5分钟,4℃保持。
本发明进一步还提供了利用上述标记物预测患2型糖尿病肾病发生风险的方法,该方法包括如下步骤:
a)收取EDTA-K2抗凝静脉全血;
b)检测全血中rs3733570SNP位点的基因型;
c)所述rs3733570共显性中,T/T基因型会使患者发展为2型糖尿病肾病的风险与正常患者相比增加7-8倍。
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