[发明专利]预测晚期非小细胞肺癌含铂化疗疗效及生存期的分子标记及试剂盒无效
| 申请号: | 201410240846.2 | 申请日: | 2014-06-02 |
| 公开(公告)号: | CN104017874A | 公开(公告)日: | 2014-09-03 |
| 发明(设计)人: | 卢大儒;陈红岩;王诗铭 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 上海正旦专利代理有限公司 31200 | 代理人: | 陆飞;盛志范 |
| 地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 预测 晚期 细胞 肺癌 化疗 疗效 生存 分子 标记 试剂盒 | ||
技术领域
本发明属于医学分子遗传学和临床医学技术领域,具体涉及一种预测晚期非小细胞肺癌接受含铂化疗后临床获益率及无疾病进展生存期的分子标记及试剂盒。
背景技术
恶性肿瘤是严重威胁人类生命健康的杀手之一,而肺癌是发病率最高、死亡率最高的恶性肿瘤,最常见的肺癌类型为非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer, NSCLC),约占全部肺癌患者的80%左右,大部分非小细胞肺癌患者在确诊时已经处于晚期,不再适合手术治疗,因此以化疗为主的综合治疗成为了晚期非小细胞肺癌的标准治疗,而含铂化疗因具有较强的抗肿瘤效果而广泛应用于临床治疗晚期非小细胞肺癌。目前,含铂化疗在临床治疗晚期非小细胞肺癌中取得了显著效果:有效率达到30%,中位生存期8~10个月,2年生存率约10%~15%。然而,不同个体在临床治疗中对含铂化疗表现出显著不同的敏感性。因此,深入研究影响晚期非小细胞肺癌化疗疗效相关因素,提高临床治疗效率,具有重要的临床意义。以此为理论依据,为肺癌个体化医疗提供基础,是当今肺癌个性化医疗研究领域的热点和难点。
随着分子生物学技术与基因组学的不断发展,肺癌个体化医疗研究已经由传统的体外药敏实验研究方法,发展为基于基因组学及蛋白质组学基础研究的高通量筛选肿瘤化疗分子标志物的研究方法,包括肿瘤组织表达谱、DNA甲基化、miRNA、单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism, SNP)等。随着高通量技术的不断发展,基于普遍性存在且具有特异性的SNP逐步成为个体化医疗中最为广泛应用的生物遗传分子标记物。从肿瘤化疗疗效评估来看,虽然化疗疗效与肿瘤组织基因组、转录组及蛋白表达量的变化最为相关,但大多数晚期非小细胞肺癌患者已经不适合手术,获得肿瘤组织十分不易,故常用比较容易获得的外周血进行外周血基因组SNP多态性检测来探索化疗疗效与遗传因素的相关性。因此,通过外周血基因组DNA检测SNP多态性成为了临床评估肺癌化疗疗效的最常用研究方法。
mTOR(mammalian target of rapamycin, mTOR)信号通路在细胞生存、细胞生长及增殖起着关键的调控作用,与细胞凋亡及自噬、蛋白质合成、免疫、细胞运动及代谢等有着密切的关系。研究表明,mTOR信号通路异常与多种恶性肿瘤的发生发展相关,且与药物敏感性有着密不可分的关系。RICTOR基因编码的RICTOR蛋白是mTOR通路中mTORC2复合体的成分之一,研究表明,mTORC2复合体参与细胞骨架形成,RICTOR作为mTORC2的主成分之一在肿瘤发展与转移中起着十分关键的作用,且RICTOR参与Akt的完全活化从而影响Akt通路下游调节子的功能,进而调节Akt通路在细胞凋亡中的功能。
本发明研究了RICTOR基因的多态性位点与晚期非小细胞肺癌患者接受含铂化疗后的临床获益率及无疾病进展生存期的相关性,发现一个该基因的一个单核苷酸多态性与含铂化疗临床获益率及无疾病进展生存期显著相关,该分子标记可应用于预测晚期非小细胞肺癌患者含铂化疗预后情况,为此类病人的个体化医疗提供依据。
发明内容
本发明的目的在于提供一种可应用于临床预测晚期非小细胞肺癌患者含铂化疗预后(化疗后临床获益率及无疾病进展生存期)的分子标记及试剂盒。
本发明提供的预测晚期非小细胞肺癌患者含铂化疗预后的分子标记,该预测功能可通过对患者外周血基因组DNA的分子标记的检测而实现。上述分子标记包括与晚期非小细胞肺癌含铂化疗临床获益率及无疾病进展生存期相关的RICTOR基因及该基因上单核苷酸多态性位点rs6878291。
作为上述分子标记的应用,本发明还提供用以预测晚期非小细胞肺癌患者含铂化疗预后的RICTOR基因多态性检测试剂盒。
该试剂盒包括:
(1)检测RICTOR基因上rs6878291多态性位点基因型的特异性引物对,所述的特异性引物对是指针对RICTOR基因rs6878291多态性位点而设计,能特异性扩增出包含这个SNP位点的DNA片段的引物对,特异性引物对可用常规的合成技术进行合成。所述引物对可用如下序列:正向引物:5’-CCCATCACTCTTACCTAAACTCTC-3’(SEQ ID NO.1);反向引物:5’-GACTGTGGTAGGCATTTGAAGATA-3’(SEQ ID NO.1)。
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