[发明专利]用于肺癌的诊断、预后和治疗的基于微小RNA的方法和组合物

说明书

发明人:Carlo M.Croce，Nozomu Yanaihara和Curtis C.Harris

本申请是申请日为2007年1月3日、申请号为200780006750.8、发明名称为“用于肺癌的诊断、预后和治疗的基于微小RNA的方法和组合物”的申请的分案申请。

政府资助

本发明全部或部分由来自CCR/NCI/NIH的基金CA76259和校内基金资助，也依照合同号NO1-CO-12400由来自NCI/NIH的联邦基金资助。政府具有本发明的某些权利。

发明背景

在世界范围内，肺癌造成比任何其它形式的癌症更多的死亡(Goodman，G.E.，Thorax57:994-999(2002))。在美国，肺癌是男性和女性癌症死亡的主要原因。在2002年，肺癌死亡率估计是134,900例。肺癌也是所有欧洲国家癌症死亡的主要原因，肺癌-相关死亡的数目在发展中国家也快速增加。

无论在诊断时的疾病阶段，所有肺癌患者的五年生存率仅是约13％。这与在该疾病仍然在局部时检测出的病例的46％的五年生存率形成对比。但是，在该疾病已经扩散之前，仅16％的肺癌被发现。早期检测是困难的，因为在该疾病已经达到晚期之前经常观察不到临床症状。目前，使用胸部X线、痰中含有的细胞类型的分析和支气管气道的纤维光学检查来辅助诊断。治疗方案由癌症的类型和阶段决定，包括手术、放疗和/或化疗。尽管对该癌症和其它癌症的治疗进行了大量研究，肺癌仍然难以有效地诊断和治疗。因此，非常需要改进的检测和治疗这些癌症的方法。

Carbone,J.Clin.Oncol.23:3219-3226(2005)；Granville和Dennis,Cell Mol.Biol.32:169-176(2005))。例如，p53和RB/p16途径中的缺陷是肺癌中常见的。几个其它的基因，例如K-ras,PTEN,FHIT和MYO18B，在肺癌中发生遗传改变，尽管频率更低(Minna等人,Cancer Cell1:49-52(2002)；Sekido等人,Annu.Rev.Med.54:73-87(2003)；Yokota和Kohno,Cancer Sci.95:197-204(2004))。尽管对已知的基因和蛋白的关注已经产生了有用的信息，以前未知的肺癌标记也可以导致对肺癌生物学的洞察。

微小RNA(miRNA)是通过与信使RNA(mRNA)靶杂交并引发对它的翻译抑制或较不常见地引起其降解来控制基因表达的一类小的非编码RNA。miRNA的发现和研究已揭示在生物发育和各种细胞过程例如细胞分化、细胞生长和细胞死亡中发挥重要作用的miRNA介导的基因调控机制(Cheng，A.M.，等人，Nucleic Acids Res.33:1290-1297(2005))。近年来的研究表明，特定miRNA的异常表达可参与人的疾病，例如神经障碍(Ishizuka，A.，等人，Genes Dev.16:2497-2508(2002))和癌症。具体地，已在人慢性淋巴细胞性白血病中发现miR-16-1和/或miR-15a的不当表达(Calin，G.A.，等人，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.99:15524-15529(2002))。

含有所有已知的人微小RNA的微阵列的开发和应用，已经允许同时分析样品中每种miRNA的表达(Liu,C.G.等人,Proc Natl.Acad.Sci.U.S.A.101:9740-9744(2004))。这些微小RNA微阵列不仅已经用于证实miR-16-1在人CLL细胞中失调，而且用于产生与明确定义的人CLL的临床病理学特征有关的miRNA表达特征(Calin,G.A.等人,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.101:1175-11760(2004))。

对在肺癌细胞中差异表达的微小RNA的鉴定，会辅助诊断、预测和治疗肺癌。此外，对这些miRNA的推定靶的鉴定，会辅助解释它们的致病作用。本发明提供了用于肺癌的诊断、预后和治疗的新的方法和组合物。

发明内容

本发明部分地基于与肺癌细胞中改变的表达水平有关的特定miRNA的鉴定。