[发明专利]一种生物信息学高性能计算平台的测试方法

权利要求书

1.一种生物信息学高性能计算平台的测试方法, 其特征在于,该测试方法依据生物信息学计算的需求，配置适合的硬件环境进行测试，测试中考虑系统性能是否正常，应用软件以及算例的选择是否具有生物信息学软件的代表性，测试用例的压力是否足够大等，并最后给出固定平台下的资源使用情况；

该方法主要包括确定适用于生物信息学平台的硬件平台，搭建测试环境，安装生物信息学软件，选择具有代表性的测试用例。

2.根据权利要求1所述的生物信息学高性能计算平台的测试方法，其特征在于,

所述硬件平台使用于生物信息学的数据分析，选用了128GB的内存容量，多块盘做RAID0，存储空间为2TB。

3.根据权利要求2所述的生物信息学高性能计算平台的测试方法, 其特征在于, 所述搭建测试环境是指，在确定硬件平台配置后，在其上安装操作系统，系统中部署软件，安装编译器，并行环境。

4.根据权利要求3所述的生物信息学高性能计算平台的测试方法, 其特征在于,所述系统中部署软件包括intel编译器、mpi。

5.根据权利要求3所述的生物信息学高性能计算平台的测试方法, 其特征在于,所述安装生物信息学软件是指,在系统中部署应用软件，选用序列比对软件BWA和序列拼接软件VELVET进行测试；对于测试用例的的规模，选用ILLUMIA的测序数据进行分析。