[发明专利]一种与猪肉pH性状相关的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.一种与猪肉pH性状相关的SNP分子标记，其核苷酸序列如下所示：

ATTTCTGCCCGGTCACGAGTGGAACTGCAAGAAGATAGTTCTGCTCGAGACAGAGGCTGGGCCTGCCCATCTCATCTCCCTTCTTTCTTCAGTGAGACCCTCTTCTTCTGGAAGCTGGTTTCACATGGTGGCTTAGATTTTTCCATCTTTGTATCTAGCACCATTTGAAATCAGTGTTTTAGGAGTAAGAATTGCAGCACAGCCAAAGGCCAACTGCAGAGGAGCAGCTGTTCTGGGAACCAGCTCCCCCCGCCTCCTCCACCTGAGCCGGTTCAAGAAGGGAAGAGCCTGAGCAGCACAGCACACGCTCGAGTGGGTCGGGCGGTGCAGGAGGACAGTGCAGGGGTGGGAATCGTTCAAAGGAAACGCAGGGGCTTGAGCAGGGCCGGGGCTTGCGAAGGGCTTCGTGTGCACAGGTAGCAGCAGCCACCAGCCGTAAGCCGCTGGTCAGACCTGTGCGCGCGCGGGTGGGCCGTGCTGAGCTGGGTGCTCCACGGCCACAGGGACGGGAAGGCTCTGTCCCGGGAGGATTGTCACGTCGCAGCCGCACTGTCCTCCGGCTCCTAGCTGCCGGGAACCTTCAGCTGCAGGTTCCGCACAGCTGAAATCGGACCTGCCTCCTGCAGTGCCARGGTGCTGGACCCCACCGAGCCCCGCTGGACCCATCTCTTACACAGGCTGACCGATTTCTCCTGGTGTTCAGAGTCTGTTTTTGTCTAGCACCATTTGAAATCGGTTATGATGTAGGGGGA

上述序列中的632位的R为T或C，导致NcoⅠ-RFLP多态性。

2.扩增如权利要求1所述分子标记的引物组合，其DNA序列如下所示：

正向引物：ATTTCTGCCCGGTCACGAGT，

反向引物：TCCCCCTACATCATAACCGA。

反转录miR-29c的特异引物：

CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGTAACCGAT。

3.权利要求1所述的分子标记在猪肉pH性状相关的SNP分子标记性状检测中的应用。

4.权利要求2所述的引物组合在猪肉pH性状相关的SNP分子标记性状检测中的应用。

5.一种与猪肉pH性状相关的SNP分子标记的制备方法，其特征在于下列步骤：

提取猪基因组DNA，根据的猪miR-29b-2/c簇序列信息，选取miR-29-b2/c初始转录本上下游各2000bp的序列设计PCR扩增引物组合，其核苷酸序列如SEQ ID NO：2和3所示，用该引物组合进行PCR扩增，得到752bp的扩增片段，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，对所获得的PCR产物酶切分型，进行基因型与猪肉pH性状相关的SNP分子标记之间的关联分析。