[发明专利]用于检测烟草对TMV抗性的N基因特异性引物对、检测方法及试剂盒有效

专利信息
申请号: 201410135454.X 申请日: 2014-04-04
公开(公告)号: CN103866038A 公开(公告)日: 2014-06-18
发明(设计)人: 张玉;罗成刚;杨爱国;张伟;蒋彩虹;常爱霞;冯全福;钱玉梅;程立锐;耿锐梅;任民 申请(专利权)人: 中国农业科学院烟草研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京市盛峰律师事务所 11337 代理人: 席小东
地址: 266101 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 用于 检测 烟草 tmv 抗性 基因 特异性 引物 方法 试剂盒
【说明书】:

技术领域

发明属于生物化学与分子生物学领域,具体涉及一种用于检测烟草对TMV抗性的N基因特异性引物对、检测方法及试剂盒。

背景技术

烟草普通花叶病(TMV,tobacco mosaic virus)是全世界烟草栽培区发生普遍、危害严重的一大病害。发病后,烟叶产量降低,品质变劣,对烟叶生产带来极大危害。目前,对于TMV的防治没有效果较好的药剂,只能采取提前预防、综合防治等措施,由于受耕地资源紧张、连作的影响,培育抗TMV的烟草品种在生产中显得尤为迫切和重要。

N基因起源于野生种黏烟草(Nicotiana glutinosa),是目前已经明确的烟草抗TMV基因,是烟草抗TMV育种的主要抗源。1938年,F.Q.Holmes等研究表明,黏烟草对TMV的抗性是由显性单基因N基因控制的;1994年,S.Whitham等通过转座子标签法克隆得到N基因,并证明其介导的TMV抗性可以产生过敏性坏死反应。N基因全长为6656bp,包括5个外显子和4个内含子,编码NS和NL两种转录产物,属于TIR-NBS-LRR类抗病基因。国外已经利用N基因介导的TMV抗性育成了一批高抗TMV的烟草品种,包括Ky56、By21、NC75、VA770、TN86、Coler176、Coker86等。我国也利用该抗源培育了一系列抗TMV品种(系),如:利用Ky56作为亲本育成了辽烟8号、辽烟10号等抗TMV品种;利用Coker86的抗病性,育成了辽烟13、辽烟14等抗TMV品种。这些品种在我国的烟草生产中发挥了重要作用。

在传统的抗TMV育种中,为鉴定所培育的品种是否具有TMV抗性,通常采取田间鉴定方法,即:需要对育种材料进行单株接种并创造合适的发病条件,因此,如果接种不成功或条件不合适,均会影响品种抗性判断结论,具有品种抗性判断效率低的不足。

发明内容

针对现有技术存在的缺陷,本发明提供一种用于检测烟草对TMV抗性的N基因特异性引物对、检测方法及试剂盒,利用N基因特异引物序列检测不同育种材料TMV抗性,为烟草抗TMV育种提供一条快捷有效的方法,不受生长条件和发育时期的影响,可以快速高效的检测N基因控制的TMV抗性,加快抗TMV种质资源和优良品种筛选,还具有操作简便、结果可靠、检测速度快等优点,能够极大地加速材料的选育过程,缩短育种周期,提高育种效率。

本发明采用的技术方案如下:

本发明第一目的为提供一种用于检测烟草对TMV抗性的N基因特异性引物对,包括上游引物NPF和下游引物NPR;

所述上游引物NPF的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;

所述下游引物NPR的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。

本发明第二目的为提供一种烟草是否具有N基因介导的TMV抗性的检测方法,包括以下步骤:

S1,利用Genbank提供的烟草基因组序列进行Blast比对,查找被检测烟草的N基因序列特异区域,并在该特异区域设计N基因特异性引物对;其中,所述N基因特异性引物对包括:上游引物NPF的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;下游引物NPR的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;

N基因序列特异区域的序列如下:

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