[发明专利]一种新的食管癌标志基因的检测及应用有效
申请号: | 201410118231.2 | 申请日: | 2014-03-27 |
公开(公告)号: | CN103923985B | 公开(公告)日: | 2017-04-12 |
发明(设计)人: | 曹秀峰;李苏卿;史卫红;仝宇梭;庹磊;汪春梅;谢海伟;刘子豪;杨同昕;吕进;纪律;朱斌;王和明;李义生 | 申请(专利权)人: | 南京市第一医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
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地址: | 210006 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 食管癌 标志 基因 检测 应用 | ||
1.一种长链非编码RNA在制备用于食管癌辅助诊断或者疗效预测试剂中的应用。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于所述食管癌为食管鳞状细胞癌。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于所述长链非编码RNA序列如序列表中SEQ ID NO.1所示。
4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述的用于食管癌辅助诊断或者疗效预测的试剂为实时定量PCR检测试剂。
5.一种用于食管癌辅助诊断或者疗效预测的实时定量PCR检测试剂盒,其特征在于,包括根据核苷酸序列为SEQ ID NO.1的长链非编码RNA设计并合成出特异性用于实时定量PCR的检测引物。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,用于长链非编码RNA实时定量PCR检测的特异性引物如序列表中SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.7所示。
7.一种长链非编码RNA的检测方法,包括样品RNA的提取、样品cDNA的制备、lncRNA的扩增。
8.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于,所述的样品RNA的提取、样品cDNA的制备、lncRNA的扩增的具体步骤包括:
1)样品总RNA的提取:按照Life Technologies公司的试剂所需试剂及步骤提取食管鳞状细胞癌组织或肿瘤的Total RNA;再用NanoDrop ND-1000核酸定量仪定量(NanoDrop Technologies,Wilmington,Delaware)定量所提取的RNA的纯度和浓度,甲醛变性胶电泳质检确保提取的RNA的完整性。
2)样品cDNA的制备:采用TaKaRa试剂盒PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)(货号RR047A)对提取的总RNA反转录合成cDNA;该试剂盒内含RNase-Free DNase,可有效去除混杂的基因组DNA。
3)lncRNA的扩增:采用TAKARA SYBR PremixEx TaqTM II(TIi RNaseH Plus)荧光定量试剂盒,以反转录的cDNA为模板进行荧光定量PCR扩增。
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