[发明专利]一种松江鲈鱼微卫星标记的3重PCR检测方法无效
| 申请号: | 201410118158.9 | 申请日: | 2014-03-26 |
| 公开(公告)号: | CN103937882A | 公开(公告)日: | 2014-07-23 |
| 发明(设计)人: | 张志勇;张志伟;徐献明;许津;沈德华;张曹进;吴建平;吴国均;任忠宏 | 申请(专利权)人: | 江苏省海洋水产研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达 |
| 地址: | 226007 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 松江 鲈鱼 卫星 标记 pcr 检测 方法 | ||
1.一种松江鲈鱼微卫星标记的3重PCR检测方法,包括:
(1)剪取松江鲈鱼的鳍条,提取基因组DNA;
(2)合成不同位点的微卫星正反向引物,引物序列如下:
SJL-C47:F:GGAGGCGGATGATGTTGGA;
R:ACTGCGGTAATGTGCGTTTC;
SJL-B61:F:ACCAGTTCCATCCAGCAGTTG;
R:CCGACACGCTCACCGTATTTC;
SJL-D25:F:GAATGCGGGTTCAAGGTAG;
R:GGCACATAACGGCTTCACTG;
(3)运用优化好的PCR扩增体系和扩增程序对不同松江鲈鱼个体进行3重PCR扩增;
(4)对PCR产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,确定个体的基因型,获得松江鲈鱼遗传多态性图谱。
2.根据权利要求1所述的一种松江鲈鱼微卫星标记的3重PCR检测方法,其特征在于:所述步骤(3)中的PCR扩增体系为10×Buffer5μL,25mM MgCl23μL,各含10mM dNTP1.0μL,100ng/μL模板1μL,SJL-D25、SJL-B61、SJL-C47正反向引物各1μL,5U/μL Taq DNA聚合酶0.4μL,ddH2O8.6μL。
3.根据权利要求2所述的一种松江鲈鱼微卫星标记的3重PCR检测方法,其特征在于:所述10×Buffer中含有200mM Tris-HCl pH8.825℃,100mM KCl,100mM(NH4)2SO4,1.0%TritonX-100。
4.根据权利要求1所述的一种松江鲈鱼微卫星标记的3重PCR检测方法,其特征在于:所述步骤(3)中的PCR扩增程序为94℃变性5min后进行下面程序:94℃变性30S,55℃退火30S,65℃延伸1min,进行30个循环,最后65℃延伸7min。
5.根据权利要求1所述的一种松江鲈鱼微卫星标记的3重PCR检测方法,其特征在于:所述步骤(4)中的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测具体为:首先用2%的琼脂糖凝胶电泳,EB染色判断产物的有无,然后用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶200V恒电压电泳1.5小时,7.5%的醋酸溶液固定15min,接着用去离子水洗胶3次,每次5min,然后0.15%的硝酸银溶液银染30min,显影2-3min,最后固定5min。
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