[发明专利]鉴别11种鸭病毒病的GeXP检测试剂盒有效

专利信息
申请号: 201410037453.1 申请日: 2014-01-26
公开(公告)号: CN103773899A 公开(公告)日: 2014-05-07
发明(设计)人: 谢芝勋;张艳芳;谢丽基;刘加波;庞耀珊;范晴;罗思思;邓显文;谢志勤 申请(专利权)人: 广西壮族自治区兽医研究所
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅
地址: 530001 广西*** 国省代码: 广西;45
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摘要:
搜索关键词: 鉴别 11 病毒 gexp 检测 试剂盒
【说明书】:

技术领域

发明涉及生物技术领域,尤其涉及鉴别11种鸭病毒病的GeXP检测试剂盒。

背景技术

H5、H7和H9亚型禽流感病毒、鸭肝炎病毒、鸭瘟病毒、鸭黄病毒、新城疫病毒、减蛋综合征病毒、番鸭呼肠孤病毒、番鸭细小病毒和鸭圆环病毒是严重危害鸭的11种主要传染性疾病。随着养鸭业的发展,鸭传染性病毒病的发病率也在逐渐升高,已成为限制养鸭业发展的一大重要因素。鉴别诊断这些鸭传染性疾病的传统方法,主要包括病原分离鉴定和血清学试验等,但这些方法常受临床病料新鲜度、污染程度或病程的限制,操作也十分繁琐、费时,对多重混合感染的鉴别诊断就更为困难。近年来,随着分子生物学的发展,PCR技术已被广泛应用于这些鸭传染病的检测,并建立了多重PCR检测技术,同时检测几种病原,但需几对引物组合在一起同时竞争地扩增,引物之间会产生相互干扰,多增加一对引物,敏感性就越低。PCR产物需通过琼脂糖电泳才可观察结果,该电泳难以区分50bp-100bp以内的条带,一般只可做到2-4重PCR,难以达到高通量的检测。多重荧光PCR一般只检测到3重,由于探针要标记不同发光波长的荧光基团,如标记太多的荧光基团,相互会产生干扰,因此,也只能检测到2-4重。由于在多重PCR反应体系中同时存在几对引物,使得形成复杂引物二聚体的概率大大增加,同时检测的目的基因数量有限(多在2-4个基因),使得多重PCR还达不到高通量快速检测和分析的目的。

GeXP系统(Gene Expression Profiler Genetic Analysis System)是美国Beckman Coulter公司研发的用于研究多基因表达定量分析的平台,由两部分组成:用于设计引物的GeXP eXpression Profiler软件和用于结果分析的GenomeLabTM GeXP Genetic Analysis System毛细管电泳仪,后者可清晰分离出相差7bp以上的相邻扩增片段。GeXP多重PCR扩增采用荧光标记通用引物和特异性嵌合引物(即基因特异性引物5’端连接通用引物序列)相结合引发多重体系扩增。PCR反应之初,先由反向特异性嵌合引物与原始模板结合进行逆转录反应,再由正向特异性嵌合引物合成cDNA的第二链,此后,由正、反向嵌合引物的特异性序列以cDNA为模板启动PCR反应,分别扩增出通用引物的互补序列;再由反应体系中占主导地位的荧光标记通用引物,与其互补序列结合,引发后续扩增,通用引物与反应体系中带有荧光标记的碱基序列互补,PCR产物经GeXP毛细管电泳分离,含有荧光标记的PCR产物经GeXP检测窗口检测,依据检测片段与标准分子片段(DNA Size Standard,DSS)迁移时间计算出扩增片段的长度,荧光信号强度代表该分离片段的扩增含量。GeXP系统可在同一个体系里对多达40个目的基因进行有效分析。

利用GeXP多重基因表达遗传分析系统,建立一种能同时鉴别多种病原体的检测方法和检测试剂盒,关键是设计特异性引物,将多重引物组合,利用通用引物,把多重引物的扩增转化为1对通用引物的扩增,从而达到高通量检测的目的。目前,还没有基于GeXP系统的同时可检测鸭源多种传染性疾病病原体的试剂或试剂盒。

发明内容

本发明的一个目的是提供鉴定或辅助鉴定鸭传染病病原体的GeXP检测引物组。

本发明提供的鉴定或辅助鉴定鸭传染病病原体的GeXP检测引物组,由单独使用的引物对A、引物对B、引物对C、引物对D、引物对E、引物对F、引物对G、引物对H、引物对I、引物对J、引物对K和引物对L组成;

所述引物对A由序列表序列1所示的单链DNA和序列表序列2所示的单链DNA组成;

所述引物对B由序列表序列3所示的单链DNA和序列表序列4所示的单链DNA组成;

所述引物对C由序列表序列5所示的单链DNA和序列表序列6所示的单链DNA组成;

所述引物对D由序列表序列7所示的单链DNA和序列表序列8所示的单链DNA组成;

所述引物对E由序列表序列9所示的单链DNA和序列表序列10所示的单链DNA组成;

所述引物对F由序列表序列11所示的单链DNA和序列表序列12所示的单链DNA组成;

所述引物对G由序列表序列13所示的单链DNA和序列表序列14所示的单链DNA组成;

所述引物对H由序列表序列15所示的单链DNA和序列表序列16所示的单链DNA组成;

所述引物对I由序列表序列17所示的单链DNA和序列表序列18所示的单链DNA组成;

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