[发明专利]胎儿DNA芯片及其应用

权利要求书

1.一种胎儿DNA芯片，包括固相载体和固定在固相载体上的寡核苷酸探针点阵，其特征在于，所述寡核苷酸探针包含对应于125种怀孕期常见胎儿遗传性和出生缺陷型疾病相关基因的寡核苷酸序列，所述125种疾病包括1q21.2缺失或重复、1q41-q42缺失、2p15p16.1缺失症候群、2q22.3缺失症候群、2q37缺失、3q29缺失症候群、5q21.1-q31.2缺失症候群、7q11.23重复、8p23.1缺失症候群、9p部分单体性综合症、9q34.3缺失症候群、10q22.3-q23.31缺失、11q11-q13.3重复、15q24片段缺失、16p11.2-p12.1缺失、17p11.2重复、17q21.31缺失、18p缺失症候群、18q缺失症候群、22q11.2缺失或重复、22q13.3片段缺失症候群、阿拉吉欧症候群、甲型地中海贫血、亚伯氏症候群、雄性激素不敏感症候群、非倍体变异、天使症候群、安格曼症候群、威尔姆氏肿瘤、无虹膜、性器异常、智能障碍症候群、巨头、多发脂肪瘤和血管瘤综合症、基底细胞痣综合症、贝克威思-威德曼综合症、两极情绪违常/躁狂症、Branchio-Oto-Renal症候群、布鲁顿氏低免疫球蛋白症、短指发育不良及性反转、皮肤症候群、猫眼综合症、恰克-马利-杜斯氏症、CHARGE联合畸形、锁颅骨发育异常症、狄兰吉氏症候群、多发性错构瘤综合症、猫鸣症候群、皮肤松垂症、胱氨酸血症、Dandy-Walker症候群、先天性膈疝、颚心面综合症、唐氏综合症、杜兴氏肌肉萎缩症、Dyggve-梅尔基奥尔-克劳森综合症、Feingold 综合症、前脑缺损、脆X综合症、甘油激酶缺乏症、Greig头多并指综合症、遗传性压力易感性神经病变、前脑发育畸形症1型、前脑发育畸形症2型、前脑发育畸形症3型、前脑发育畸形症4型、前脑发育畸形症5型、前脑发育畸形症6型、前脑发育畸形症7型、前脑发育畸形症9型、婴儿期痉挛综合症、雅各布森综合症、joubert氏症候群、卡门氏症候群、促性腺激素分泌不足的低性腺功能症和嗅觉缺失、兰-吉综合症、莱希尼亨症候群、脑白质失养症、平脑症、男性MECP2拷贝数变异、Menkes氏症候群、缅克斯症候群、孟奇病、小眼球合并皮肤缺损、小脑症、先天性心脏病、小眼综合症、垂体发育不全小眼综合症、无脑回畸形、粘多糖贮积症、甲髌骨症候群、肾消耗病/肾结核、努南氏症候群、欧比司症候群、口面指/趾综合症、帕利斯特-基利安镶嵌综合症、慢性儿童型脑硬化症、着丝粒周缘区域缺失、Potocki-Shaffer 综合症、普瑞德威利症候群、Prader-Willi-like 表型、瑞特氏症候群、里格尔综合症、鲁宾斯坦-泰比症候群、骶骨/肛肠畸形综合症、萨一邱氏症候群、史密斯-马吉利氏症候群、脑性巨大畸形、索特斯症侯群、裂手裂足症1型、裂手裂足症3型、端粒及近端区缺失综合症、并多指/趾畸形、血小板过低合并桥骨缺失症候群、Treacher Collins症候群、楚列雀可林斯症候群、毛发-鼻-指/趾综合症、范德伍兹综合症、瓦登伯革氏症候群、威廉氏症候群、沃夫-贺许宏氏症、X染色体失活、X连锁脏器异位症候群、X连锁淋巴组织增生综合症、Xp11.3缺失伴智障、X连锁鱼鳞病。

2.根据权利要求1所述的胎儿DNA芯片，其特征在于，所述寡核苷酸探针至少满足如下设计要求：（1）跳过目标序列中重复的屏蔽区域；（2）与互补基因序列杂交后的解链温度尽可能接近80℃的解链温度；（3）寡核苷酸长度在45-60mer之间；（4）寡核苷酸序列中G+C含量在40-60%之间；（5）寡核苷酸序列中避免有5个以上重复碱基。

3.根据权利要求1所述的胎儿DNA芯片，其特征在于，所述寡核苷酸探针以阵列方式排布在固相载体上。

4.根据权利要求1或3所述的胎儿DNA芯片，其特征在于，至少对于其中选定的一种寡核苷酸探针而言，其至少在固相载体上重复点样两次，形成均匀分布的探针重复点，并且，所述固相载体上至少还均匀分布有阴性对照点和阳性对照点。

5.根据权利要求1或3所述的胎儿DNA芯片，其特征在于，所述寡核苷酸探针在固相载体上的排布顺序至少满足如下要求：对照探针占比大于1%，探针间的间距大于200bp，探针效能分的平均值大于0.75，重复探针的数量大于300个，重复次数为2-5次。