[发明专利]一种获得寡核苷酸探针的方法有效
| 申请号: | 201410001939.X | 申请日: | 2014-01-02 |
| 公开(公告)号: | CN103710455A | 公开(公告)日: | 2014-04-09 |
| 发明(设计)人: | 唐宗祥;符书兰 | 申请(专利权)人: | 四川农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/10 |
| 代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 龚燮英 |
| 地址: | 611130 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 获得 寡核苷酸 探针 方法 | ||
1.一种获得寡核苷酸探针的方法,其特征在于,该获得寡核苷酸探针的方法包括以下步骤:
步骤一,从NCBI网站中下载pSc119.2,pAs1,pTa-535,pTa71,pAWRC.1和CCS1的原始序列;
步骤二,用生物信息学软件DNAMAN,对下载的各序列进行分析,寻找这些序列中重复的核心单元,再回到NCBI网站中利用blastn工具进行比对,力争找到长度在60bp以下的核心寡核苷酸序列,以用作探针合成;
步骤三,将初步筛选出的众多寡核苷酸序列进行探针合成;
步骤四,待探针合成后,逐条进行FISH试验,验证探针的功能,验证合成的寡核苷酸序列是否能起到pSc119.2,pAs1,pTa-535,pTa71,pAWRC.1和CCS1的FISH效果;获得寡核苷酸探针。
2.如权利要求1所述的获得寡核苷酸探针的方法,其特征在于,寡核苷酸序列包括:Oligo-pAs1-1、Oligo-pAs1-2、Oligo-pTa535-1、Oligo-pTa535-2、Oligo-pSc119.2-1、Oligo-pSc119.2-2、Oligo-pTa71-2、Oligo-pAWRC.1、Oligo-CCS1。
3.如权利要求2所述的获得寡核苷酸探针的方法,其特征在于,寡核苷酸序列Oligo-pAs1-1和Oligo-pAs1-2作探针,分别都能代替pAs1鉴定小麦D组染色体。
4.如权利要求2所述的获得寡核苷酸探针的方法,其特征在于,寡核苷酸序列Oligo-pTa535-1和Oligo-pTa535-2作探针,分别都能代替pTa-535鉴定小麦A组和D组染色体。
5.如权利要求2所述的获得寡核苷酸探针的方法,其特征在于,寡核苷酸序列Oligo-pSc119.2-1和Oligo-pSc119.2-2作探针,分别都能代替pSc119.2鉴定小麦B组染色体和黑麦的各条染色体。
6.如权利要求2所述的获得寡核苷酸探针的方法,其特征在于,寡核
苷酸序列Oligo-pTa71-2作探针,可以代替pTa71检测小麦族植物的核仁组织区。
7.如权利要求2所述的获得寡核苷酸探针的方法,其特征在于,寡核苷酸序列Oligo-pAWRC.1作探针,可以代替pAWRC.1检测黑麦染色体着丝粒结构,将黑麦着丝粒和其它小麦族植物的着丝粒区分开。
8.如权利要求2所述的获得寡核苷酸探针的方法,其特征在于,寡核苷酸序列Oligo-CCS1作探针,可以代替CCS1检测小麦族植物染色体着丝粒结构。
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