[发明专利]用于样品制备的反应容器在审

专利信息
申请号: 201380072875.6 申请日: 2013-12-19
公开(公告)号: CN104994956A 公开(公告)日: 2015-10-21
发明(设计)人: 尼尔斯·A·库拉克;马提亚·曼恩;赛义德·巴贝克·阿兹米菲尔;纳加朱纳·纳加拉杰 申请(专利权)人: 马克斯·普朗克科学促进协会
主分类号: B01L3/00 分类号: B01L3/00;B01D15/22;G01N30/02;G01N30/60
代理公司: 北京德恒律治知识产权代理有限公司 11409 代理人: 章社杲;李伟
地址: 德国*** 国省代码: 德国;DE
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摘要:
搜索关键词: 用于 样品 制备 反应 容器
【说明书】:

技术领域

本发明涉及用于从细胞材料、病毒和/或所述细胞材料和/或病毒的亚组分纯化和/或富集生物有机化合物的样品制备容器,容器包括反应室和层析介质;其中,所述反应室用于保持所述细胞材料、病毒和/或所述细胞材料和/或病毒的亚组分,并且配置为使得可以在其中实施以下反应的至少一个:裂解,例如,通过声波处理和/或蒸煮;层析纯化;还原;烷基化;以及诸如蛋白水解的酶促反应;其中,所述层析介质配置为纯化和/或富集所述生物有机化合物;其中,(a)所述层析介质位于所述反应室的壁上,并且所述壁是闭合或密封的并且配置成为获得纯化和/或富集的生物有机化合物而开放;或(b)所述样本制备容器还包括用于接收所述生物有机化合物的接收室,所述接收室邻近所述层析介质,从而使得所述层析介质将所述反应室和所述接收室分隔开,并且所述接收室的外面是闭合的并且配置成为获得纯化和/或富集的生物有机化合物而开放。

背景技术

在本说明书中,引用了包括专利申请和制造商的手册的许多文件。虽然不认为和本发明的专利性相关,但是这些文件的全部公开内容结合于此作为参考。更具体地,所有参考文件均相同程度地结合于此作为参考,犹如每个单独的文件特定和单独地结合于此作为参考。

用于富集特定生物材料的包括细胞裂解的样本制备方法当前应用于生物研究的基本上所有领域。DNA、RNA和蛋白质的提取、纯化和处理是用于这些和其他生物材料的体外分析的起始步骤。当前的方法涉及预净化步骤和将这些材料转移至不同的反应容器以避免阻塞诸如分析柱的分析设备以及有时富集期望的生物材料。样品的纯化在诸如结晶学和电子显微镜的生物研究的某些领域被视为是重要的。这些预清洗和样品转移步骤在样品损失、延长的样品制备时间、例如将分析的蛋白质的不期望的改性、污染的引入、在处理有害或传染性材料中的潜在危害以及材料成本方面显示出一些主要缺点。但是,它们通常被视为是不可缺少的。

由于不完全的提取以及与容器表面的扩大接触(其中发生样品吸收),在预清洗粗制的裂解液的步骤中发生样品损失。减少样品损失的当前的解决方案包括非常严密的提取方法和反应管上的低结合表面。

反复的样品转移花费时间;尤其是研究者必须存在和需要处理样品的手工操作。延长的UV光或氧暴露可能损坏样品并且可以导致不期望的化学改性。这些问题的解决方案分别是光保护容器和屏蔽气体的使用。然而,这些措施使样品处理变得更加困难和耗时。此外,在容器之间传递样品期间可能引入污染,并且目前仅可以通过在昂贵的超净工作台、层流下或具有类似的预防措施下工作来避免污染。此外,诸如病原体的有害样品带来污染与样品管接触的人或机器的风险。最后,样品制备中的任何这些低效率以及多于最少量的一次性材料的使用都可以显著地增加处理成本。

包括层析材料的诸如移液吸头的设备在本领域是已知的并且可以从若干制造商购买并且包括Pierce C-18吸头(Thermo Fisher)和C18-SD盒(3M)。这些设备在两端均开口。这样的设备不适合于单反应容器中的样品制备。本文中的样品制备包括从细胞材料制备用于质谱分析的肽和多肽和/或从细胞材料制备用于表达谱的核酸。

Rappsilber等人(Anal Chem.;75(3):663-70(2003))描述了也称为“阶段吸头”的设备,“阶段吸头”在两端均开口并且允许以紧凑的格式层析的性能。

欧洲专利申请EP1033169描述了用于固相萃取的吸附剂盒。根据EP1033169的盒的特征是在吸头的远端处具有开口,该开口标示有标号(18),该开口对于盒的功能是必要的。在远端处提供了固相萃取材料,优选地,以珠子的形式。虽然盖(32)关闭吸附剂盒的近端,但是远端需要是开放的或打开以使原材料与珠子接触。本发明的设备的底部(当使用EP1033169的术语时为“远端”)由闭合或密封的壁制成或者以闭合的接收室的形式提供。然而加载原材料是可能的,即在上(“近”)端。然而,根据EP1033169的样品加载仅当远端开放时是可能的。

发明内容

鉴于本领域中可用的工具和方法的限制,本发明的技术问题可以视为提供用于样品制备的设备和方法,其中,所述样品制备在单反应容器中实现而不用任何转移步骤。

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