[发明专利]用于HPV诱导的浸润性癌症及其高度前期病变的分子诊断标志物PRDM14和FAM19A4

权利要求书

1.用于检测HPV诱导的高度癌前病变和HPV诱导的浸润性癌症的方法，所述方法包括检测细胞中PRDM14和/或FAM19A4基因中的超甲基化，而这样的超甲基化表明存在具有浸润潜力的HPV诱导的前期病变和/或HPV诱导的浸润性癌症。

2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述HPV诱导的高度癌前病变或HPV诱导的浸润性癌症为高度宫颈癌前病变或浸润性宫颈癌。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中，所述HPV诱导的浸润性癌症为高风险HPV诱导的浸润性癌症。

4.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中，所述FAM19A4的超甲基化表明存在晚期CIN3病变。

5.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中，额外检测hsa-miR124-2的超甲基化。

6.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中，在如图1和图2所示的富CpG的序列中检测所述超甲基化。

7.根据权利要求1至6中任一项所述的用于检测HPV诱导的高度癌前病变或HPV诱导的浸润性癌的方法，其中，所述超甲基化是与相当的正常细胞相比，测试细胞中PRDM14和/或FAM19A4的富CpG启动子和/或基因组序列的甲基化增加。

8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中，所述试剂为甲基化敏感的限制性内切酶，选自由BssHII、MspI、NotI和HpaII组成的组中。

9.根据权利要求1至7中任一项所述的方法，其中，进行甲基化特异性PCR，所述甲基化特异性PCR基于DNA的亚硫酸氢盐修饰，随后进行靶向富CpG序列的特异性PCR反应。

10.根据权利要求9所述的方法，其中，使用结合于图1中所示的核酸序列PRDM14或结合于图2中所示的序列FAM19A4的核酸探针或引物。

11.根据权利要求10所述的方法，其中，所述核酸探针或引物具有可检测标签。

12.根据权利要求8、9或10所述的方法，其中，所述核酸探针具有选自由以下组成的组中的核苷酸序列：

a)在严苛条件下能够杂交至图1中所示的序列PRDM14或图2中所示的序列FAM19A4的多核苷酸序列；

b)与a)的所述多核苷酸具有至少70％同一性的多核苷酸；

c)与a)的所述多核苷酸互补的多核苷酸；以及

d)包含a)或b)的核苷酸的至少15个碱基的多核苷酸。

13.根据权利要求1至12中任一项所述的方法，其中，确定所述PRDM14和所述FAM19A4基因的甲基化。

14.PRDM14和/或FAM19A4作为分子诊断标志物在检测HPV诱导的高度癌前病变或HPV诱导的浸润性癌中的用途。

15.根据权利要求14所述的用途，其中，所述标志物的甲基化能够预测所述病变或癌的发生。

16.根据权利要求14所述的用途，其中，利用FAM19A4作为分子诊断标志物来检测晚期CIN3病变。

17.在检测HPV诱导的高度癌前病变或HPV诱导的浸润性癌的方法中使用的套装试剂盒，所述试剂盒包含：

-用于检测PRDM14和/或FAM19A4甲基化的装置，其中所述装置包含对于图1的PRDM14核苷酸序列和/或图2的FAM19A4核苷酸序列具有特异性的探针和/或引物，

-用于检测HPV感染的装置，其中所述装置包含对HPV具有特异性的探针和引物。

18.根据权利要求16所述的套装试剂盒，其中，所述试剂盒额外包含用于检测hsa-miR124-2甲基化的装置。