[发明专利]生物样品的稳定化有效
申请号: | 201380049246.1 | 申请日: | 2013-09-25 |
公开(公告)号: | CN104755628B | 公开(公告)日: | 2019-03-01 |
发明(设计)人: | 马丁·霍利茨;安娜贝尔·舒伯特;马库斯·施普伦格-豪塞尔斯;凯利·京特;拉尔夫·怀里希;乌伟·厄尔米勒 | 申请(专利权)人: | 凯杰有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
代理公司: | 中原信达知识产权代理有限责任公司 11219 | 代理人: | 杨青;穆德骏 |
地址: | 德国*** | 国省代码: | 德国;DE |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生物样品 细胞 核酸群体 稳定化 转录组 | ||
1.一种通过将含细胞的生物样品与至少一种式1的化合物相接触来稳定所述样品的方法
其中R1是氢基团或烷基基团,R2和R3是以直链或支链方式排列并具有1-20个原子的碳链长度的相同或不同的烃基团,R4是氧、硫或硒基团,其中所述式1的化合物是N,N-二烷基丙酰胺,并且其中所述方法适合于使包含在所述含细胞的样品中的细胞外核酸群体稳定。
2.权利要求1的方法,其中所述式1的化合物是N,N-二甲基丙酰胺。
3.权利要求1或2的方法,其具有一个或多个下列特征:
a)由于所述稳定化,所述样品中存在的核酸的降解减少;
b)所包含的细胞中的转录组和/或转录本水平被稳定化;
c)在稳定化后,选自c-fos、IL-1β、IL-8和p53的一种或多种标志物基因的转录本水平被稳定至少48小时;
d)基因组DNA从所述样品中包含的细胞向所述样品的无细胞部分的释放减少,和/或
e)其中所述含细胞的生物样品中包含的细胞被稳定化。
4.权利要求1或2的方法,其用于使血液样品稳定,所述方法包括将所述血液样品与N,N-二烷基丙酰胺和抗凝剂相接触,其中在所包含的细胞中的转录本水平被稳定化。
5.权利要求1或2的方法,其中所述方法具有一个或多个下列特征:
a)所述稳定化不促进所述含细胞的样品中包含的有核细胞的裂解;
b)所述稳定化方法在不对所述样品进行交联的情况下进行;和/或
c)所述稳定化不涉及诱导核酸-核酸、蛋白质-核酸和/或蛋白质-蛋白质交联的交联剂的使用。
6.权利要求1或2的方法,其中将所述含细胞的样品另外地与半胱天冬酶抑制剂相接触。
7.权利要求1或2的方法,其中将所述含细胞的样品另外地与泛半胱天冬酶抑制剂相接触。
8.权利要求1或2的方法,其中所述方法具有一个或多个下列特征:
a)N,N-二烷基丙酰胺和任选的其他添加剂被包含在稳定化组合物中,并且其中所述稳定化组合物与给定体积的含细胞的样品的体积比选自10:1至1:20、5:1至1:15、1:1至1:10和1:2至1:5;
b)使被稳定了的含细胞的样品经受核酸分析和/或检测方法;
c)从被稳定了的样品分离细胞内和/或细胞外核酸,并对分离的核酸进行分析和/或检测;
d)去除被稳定了的样品中包含的细胞;和/或
e)储存(i)被稳定了的含细胞的生物样品,(ii)已去除细胞的被稳定了的样品,和/或(iii)从所述样品中去除的细胞;
f)从被稳定了的样品分离核酸。
9.权利要求8的方法,其中对所述被去除的细胞进行分析,和/或其中从所述被去除的细胞分离生物分子。
10.权利要求8的方法,其中对所述被去除的细胞进行分析,和/或其中从所述被去除的细胞分离核酸或蛋白质。
11.一种用于从生物样品分离核酸的方法,所述方法包括下列步骤:
a)按照权利要求1至10的任一项中限定的方法使含细胞的样品稳定;
b)从被稳定了的样品分离核酸。
12.权利要求11的方法,其中步骤b)包括分离细胞内核酸。
13.权利要求11的方法,其中步骤b)包括分离细胞内RNA。
14.权利要求11至13中任一项的方法,其中步骤b)包括分离细胞外核酸。
15.权利要求11至13中任一项的方法,其中所述样品是血液,并且其中从剩余的样品分离细胞并从所述剩余的样品分离细胞外核酸。
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