[发明专利]对癌症的代理功能性诊断测试

说明书

优先权

本专利申请要求包含在美国专利临时申请号61/645,253(于2012年5月10日提出申请)和美国专利临时申请号61/780,252(于2013年3月13日提出申请)中的所有利益权利。上述两项美国专利申请书在此通过引用以其整体纳入本文。

技术领域

本发明涉及对人体标本取样评价鉴定肿瘤有用的方法。

背景技术

利用预测和预知性生物标记物与定靶癌症疗法相结合可能会是减少药物发展时间，提高药效以及指引作出临床决定的一把钥匙。虽然癌症治疗有进展，大部分化学疗法仍然是低效率及无效果的。化学疗法的总体低表现之一原因经常是所选择的治疗法和具体患者的病症没有密切对症好。精确的诊断法和治疗法相结合的个体化的医学途径可能缓解这个问题。

迄今为止只有屈指可数的生物标记物对临床肿瘤学实践有价值。部分原因是因为人们所感觉的生物标记物间是相互关联的，但是对药的机理是没有因果关系的。即便当“生物标记物”生物学与相伴的治疗法的药理学相搭配一致时，要想预测一种药是如何在患者体内工作仍然有重要的挑战。除此之外，临床发展道路要求医生们-科学家们的参与，由他们能看到生物标记物的测试的价值以及相信这能给患者带来益处。

BH3分布测试分析法(BH3profiling)测量癌细胞对化疗反应的决定性因果因素的功能性。具体地说,BH3分布测试分析法测量控制凋亡的线粒体(mitochondria)表面上的蛋白质的功能性。许多化疗依赖凋亡才能有效。测试的读数提供线粒体仅对促凋亡BH3蛋白质的BH3区域的反应。虽然已知BH3分布测试法提供一般意义上的化疗的化学敏感度或化学反应度，这个测试法迄今为止缺发支持医生对化疗试剂和癌种类作出决定的欲知能力。

本发明的总结

依照上述，一方面本发明提供对癌症患者选择某种治疗癌证方法的选择方法。此方法如下构成:对患者的肿瘤或癌细胞标本取样确定BH3分布数据或分布谱(BH3profile)；确定患者的一种或几种临床因素，以及为患者对一种或几种癌治疗有临床反应的可能性作出级别分类；从中选择一种或多种临床因素，以提高BH3分布谱和临床反应相关性的专属性和敏感性。

在一些具体化实施例中和象在此所展示，各种不同临床因素，即便那些和凋亡不相关的或未知有相关的因素，提高BH3分布测试分析法的预测能力，从而把此测试法转化成一个不仅仅是预后的，而且是预测的测试方法。

在一些具体化实施例中，在此所描述的方法提供一个诊断测试法，其可预测与细胞基因分布或状态相对配的血癌患者和/或与一定年龄相对配的血癌患者对阿糖胞苷(cytarabine)或基于阿糖胞苷的化疗和/或阿扎胞苷(azacytidine)的反应。在一些实施例中，本发明的诊断测试法包括BH3分布测试分析，包括测量BIM引起的线粒体膜电势变化。

另一方面，本发明为一个癌症患者的癌治疗定位提供一个方法，其组成如下：将患者的可渗透化的癌细胞和一个或多个BH3区域多肽相接触，由此定位其活化程度；通过免疫组织化学法和/或荧光原位杂化法(FISH)，为患者的癌细胞的一个或多个临床因素的存在与否定位；为患者对一种或几种癌治疗有反应的可能性作出级别分类。

再一方面，本发明为确定一个AML患者对阿糖胞苷和/或阿扎胞苷的反应提供一个方法。此方法如下组成:确定患者的AML癌细胞取样作BH3分布；确定患者的一种或几种临床因素，其中从年龄分布和/或细胞基因状态中选出一种或多种临床因素；为患者对一种或几种癌证治疗有临床反应的可能性作出级别分类。

本发明的细节在下面附随的详细说明中阐述。虽然相似或相同于在此描述的方法和材料能用于本发明的实践或测试，现在表述用作说明性的方法和材料。本发明的其他特点和物体以及优点是从本发明说明书和权利要求书中是明了的。专利规格详述书和附加权利要求书中，单件表达方式也包括复数除非文本内清楚地另加说明另外意思。除非另外定义，本文应用的所有科技词语具有与本发明所属的技术领域内一般技能者的普通理解相同。

附图的简单说明

图1显示代表性的BH3分布测试分析(BH3profiling)数据。此图显示出高度预处理活化的细胞系和低度预处理活化的细胞系的模式差别。相对于MRL-11，MRL-14是为BIM 0.3,PUMA 0.3和NOXA而高度预处理活化的(经MTA检测，与治疗用抑制剂活性相关联)。

图2显示代表性的治疗用抑制剂活性对传统生长抑制性EC50MTS检测数据。