[发明专利]多路生化测定中信号的编码和解码

说明书

交叉引用

本申请要求2012年2月3日提交的美国临时申请61/594,480,及2012年9月19日提交的美国临时申请61/703,093的利益，其各自通过引用其全文并入本文。

序列表

本即时申请包含经由EFS-网页以ASCII格式提交的序列表，且通过引用将其全文并入本文。所述ASCII副本，建立于2013年2月14日，被命名为38075-716.601_SL.txt，且大小为9,240字节。

技术领域

本发明涉及多路生化测定中信号的编码和解码。

背景技术

相比传统的单路反应，多路反应提供了显著的优点，包括在相同样品上执行并行的多个反应，使用相同的室执行更多个反应，以及以快速且有效的方式从样品中提取丰富信息的能力。然而，为了实现这些优点，多路测定通常需要复杂的报告机制，即光谱上可分辨的荧光或化学发光(例如，PCR、ELISA)、空间上可分辨的信号(例如，微阵列、凝胶电泳)、时间上可分辨的信号(例如，毛细管电泳)或其组合(例如，Sanger测序)。

发明内容

对可以在单一的溶液中执行的多路反应是有需求的。

本公开提供了用于分析物的多路检测的方法、组合物、系统和试剂盒。在一些情况下，本公开提供测定，所述测定能够不执行固定化(immobilization)、分离、质谱法、或解链(melting)曲线分析而明确地检测单一样品体积中的、以存在或不存在的任意组合形式的至少7种分析物中的每种分析物的存在或不存在。在一些实例中，每种分析物被编码为信号的一个(或至少一个)分量的值。

在一些实例中，本公开提供的测定能够明确地检测以存在或不存在的任意组合形式的、M种分析物的存在或不存在，其中M＝log₂(F+1)，且F是当所有分析物存在时的信号的一个分量(例如，强度)的最大累积值。

在一些情况下，每种分析物被编码为信号的第一分量中的至少一个第一值(例如，至少一个强度或强度范围)和信号的第二分量中的至少一个第二值(例如，至少一个波长或波长范围)。在一些实例中，每种分析物被编码为在信号的第二分量中的多个第二值中的每个第二值的信号的第一分量中的第一值(例如，在多个波长或多个波长范围中的每个波长或每个波长范围的信号强度或信号强度范围)。

在一些实例中，本文提供的测定能够明确地检测以存在或不存在的任意组合形式的、M种分析物的存在或不存在，其中M＝C*log₂(F+1)，其中C是用于编码分析物的第二值的数目，且F是在所有分析物存在时的、关于任意第二值的信号的第一分量的最大累积值。

在一些情况下，本公开提供的测定能够明确地检测以存在或不存在的任意组合形式的、M种分析物的存在或不存在，其中M＝(P*T)+1，其中P是编码方案中每层代码的数目，且T是层的数目。在一些情况下，层的数目T＝log₄(F+1)，且F是在所有分析物存在时的、关于任意第二值的信号的第一分量的最大累积值。

在一些实例中，第一值是强度或强度范围。在一些情况下，编码方案包括至少三个强度或强度范围。

在一些情况下，第二值是波长或波长范围。在一些实例中，编码方案包括至少五个波长或波长范围。

在一些实施例中，信号是电磁信号。在一些情况下，电磁信号是荧光发射信号。在一些实施例中，测量了在至少四个波长或波长范围处的荧光发射信号的强度。

在一些情况下，本文提供的测定利用在使用之前被冻干的试剂执行。

在一些情况下，利用包括杂交探针的试剂执行检测步骤。在一些实例中，杂交探针的数目大于分析物的数目。在一些情况下，杂交探针组包括专门用于不同分析物的一个或更多个杂交探针，且包括相同的荧光团或荧光团的组合。在一些实例中，样品与至少18个所述杂交探针接触。在一些实例中，利用包括至少一对引物的试剂执行检测步骤。在一些情况下，至少一对引物能够扩增与至少三个所述杂交探针互补的区域。

在一些实例中，在聚合酶链式反应期间产生被测量的信号。在一些情况下，聚合酶链式反应选自以下所构成的组：终点(end-point)聚合酶链式反应、实时聚合酶链式反应、数字聚合酶链式反应、及其组合。

在一些实例中，针对溶液执行至少一个累积测量。