[发明专利]用于临床决策支持的途径可视化

权利要求书

1.一种使用定义与基因表达、基因活性水平和信息流相关联的视觉元素的视觉语法(230)来帮助将基因活性途径可视化以用于临床决策支持的系统(10)，包括：

验证途径数据库，其存储多个验证途径，所述多个验证途径中的每个使用所述视觉语法来描述多个基因之间的至少一个交互作用；以及

处理器(18)，其被配置为执行存储在存储器(16)中的计算机可执行指令，所述指令包括：

视觉表示跨多个群体的至少一个基因的基因活性水平(28)；

从所述验证途径数据库(30)检索途径(32)，其中，所述途径包括所述至少一个基因；

视觉表示所述途径中的所有基因的基因活性水平(34)；

通过所述途径中的基因之间的交互作用来视觉表示信息流(36)；

将所述信息流(36)的所述视觉表示链接到针对临床医生的可行动信息(42)；

向所述临床医生输出所述信息流的所述视觉表示和被链接的可行动信息。

2.如权利要求1所述的系统，其中，所述多个群体包括正常群体、肿瘤群体和当前患者。

3.如前述权利要求中的任一项所述的系统，所述指令还包括：

对跨所述多个群体的所述至少一个基因的基因活性水平进行颜色编码，使得由不同的颜色来表示各个群体。

4.如前述权利要求中的任一项所述的系统，所述指令还包括：

对跨所述多个群体的所述至少一个基因的基因活性水平进行纹理编码，使得由不同的纹理来表示各个群体。

5.如前述权利要求中的任一项所述的系统，所述指令还包括：

视觉表示温度图形，所述温度图形根据正常群体的平均基因活性水平和肿瘤群体平均基因活性水平来示出患者中的所述至少一个基因的基因活性水平。

6.如前述权利要求中的任一项所述的系统，所述指令还包括：

使用包括闪光和移动中的至少一个的时间方面来视觉表示基因活性，其中，闪光和移动中的所述至少一个的频率与所述基因活性水平成比例。

7.如前述权利要求中的任一项所述的系统，其中，所述可行动信息包括用于处置所述患者的至少一个治疗规划。

8.如前述权利要求中的任一项所述的系统，其中，所述基因活性水平包括以下中的一个或多个的活性水平：

所述基因内的突变的数量；

所述基因的复制的数量；

基因表达水平；

所述基因的蛋白质表达水平；

基因座的DNA甲基化水平；

基因座的组织蛋白甲基化水平；

基因座的组织蛋白乙酰化水平；以及

由所述基因编码的特定蛋白质的磷酸化。

9.如前述权利要求中的任一项所述的系统，所述指令还包括：

使用色相-饱和度-亮度(HSB)空间中的视觉颜色来视觉表示基因活性水平，其中，不同的基因活性水平被分配有不同的视觉颜色，并且其中，使用连续函数来生成所述视觉表示。

10.如权利要求9所述的系统，其中，定义所述连续函数使得给定的基因具有r＝[a,b]的值的范围，其中，值被分配在所述HSB空间中，并且对于每个点r_i∈[a,b]，选择函数以按照h_i＝f(r_i)来映射所述值。

11.如前述权利要求中的任一项所述的系统，其中，应用到当前患者的治疗方案中的至少一种药物在所述患者中具有抗血管生成作用，并且其中，所述可视化途径与血管生长相关。

12.如前述权利要求中的任一项所述的系统，其中，所述信息流根据所述途径中过表达、抑制和基准表达基因中的一个或多个的可能性来描述在所述途径中捕捉到的基因之间的交互作用，并且其中，所述指令还包括确定所述途径中的所述交互作用中的一个或多个是否已经被激活。

13.如权利要求12所述的系统，所述指令还包括生成省略了节点表示并且强调了整个所述途径(222)上的所述信息流的视觉表示(220)。