[发明专利]一种矿区环境样品微生物基因组DNA与总RNA同时提取的方法

说明书

技术领域

本发明涉及DNA和RNA分离技术领域，更具体的说，特别涉及一种矿区环境样品微生物基因组DNA与总RNA同时提取的方法。 

背景技术

对环境中微生物资源的认识、开发和利用的一个很大障碍就是难以获得纯培养。据报道，目前约99％的环境微生物因生长所需的理化条件不明确尚未被纯培养(Pace，N.R.A molecular view of microbial diversity and the biosphere.Science.276(5313)，1997：734-740)，所以环境中存在大量未知的微生物资源亟待研究与开发利用。而生物冶金的关键技术之一，就是从矿区获得耐受极端环境的高效浸矿菌种，因此，为了研究、开发和利用矿区各类微生物资源，有大量基于分子生物学的研究，如：限制性片段长度多态性分析(Yin，H.et al.Molecular diversity of16S rRNA and gyrB genes in copper mines.Arch Microbiol.189(2)，2008：101-110)、实时定量PCR技术(Han，J.S.&Kim，C.G.Microbiological monitoring of acid mine drainage treatment systems and aquatic surroundings using real-time PCR.Water Sci Technol.59(11)，2009：2083-2091)、基因芯片(Guo，X.et al.RubisCO gene clusters found in a metagenome microarray from acid mine drainage.Appl Environ Microbiol.79(6)，2013：2019-2026和Xie，J.et al.GeoChip-based analysis of the functional gene diversity and metabolic potential of microbial communities in acid mine drainage.Appl Environ Microbiol.77(3)，2011：991-999)和宏基因组测序技术(Auld，R.R.，Myre，M.，Mykytczuk，N.C.，Leduc，L.G.&Merritt，T.J.Characterization ofthe microbial acid mine  drainage microbial community using culturing and direct sequencing techniques.J Microbiol Methods.93(2)，2013：108-115)等，近年相继展开，这些研究主要集中在研究有关微生物的代谢方式、基因或酶的功能、微生物群落组成及动态变化及其对环境因子的响应等方面，这些研究对认识生物冶金过程和加速其工业化起到了非常大的作用。由于这些研究手段均基于基因组DNA或mRNA的分析，且核酸质量和数量会影响数据分析的可靠性(Demeke，T.&Jenkins，G.R.Influence of DNA extraction methods，PCR inhibitors and quantification methods on real-time PCR assay of biotechnology-derived traits.Anal Bioanal Chem.396(6)，2010：1977-1990)，传统DNA与mRNA分步提取的方法会造成“时间差”，从而导致分析结果难以“同步”，而且，由于不同的研究采用了不同的核酸提取方法，而不同的提取方法又会对研究结果有影响而产生差异(Inceoglu，O.，Hoogwout，E.F.，Hill，P.&van Elsas，J.D.Effect of DNA Extraction Method on the Apparent Microbial Diversity of Soil.Appl Environ Microb.76(10)，2010：3378-3382)，导致在不同的研究之间也难以比较，因此，制定适用于矿区样品基因组DNA与总RNA同时提取的标准技术十分有必要。 

发明内容

本发明的目的在于提供一种低成本、能够同时从矿区环境样品中提取高纯度、完整性好的微生物基因组DNA与总RNA的方法。 

为了解决以上提出的问题，本发明采用的技术方案为：