[发明专利]鉴定小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型的方法及其专用标记有效
申请号: | 201310625539.1 | 申请日: | 2013-11-28 |
公开(公告)号: | CN103667464A | 公开(公告)日: | 2014-03-26 |
发明(设计)人: | 郝晨阳;秦琳;候健;王玉泉;李甜;张学勇 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/113 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴定 小麦 粒重 基因 tagw2 启动 子区 单元 方法 及其 专用 标记 | ||
1.用于鉴定小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型的试剂盒,含有如下(a)-(c):
(a)引物对1和限制性内切酶BstNI;所述引物对1为由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对;
(b)引物对2和引物对3;所述引物对2为由序列表中序列3和序列4所示的两条单链DNA分子组成的引物对;所述引物对3为由序列表中序列5和序列6所示的两条单链DNA分子组成的引物对;
(c)引物对4和限制性内切酶Hpy166II;所述引物对4为由序列表中序列7和序列8所示的两条单链DNA分子组成的引物对。
2.用于鉴定小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型的试剂盒,含有引物对1和限制性内切酶BstNI;所述引物对1为由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对。
3.利用权利要求1所述的试剂盒鉴定小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型的方法,包括如下步骤:
(1)如下a1)和a2):
a1)以待测小麦的基因组DNA为模板,采用所述引物对1进行PCR扩增,得到PCR产物1;再用所述限制性内切酶BstNI酶切所述PCR产物1,得到酶切产物1;
a2)根据步骤a1)所得的酶切产物1,按照如下方法确定所述待测小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型:若所得酶切产物1含有1361bp的DNA片段,则所述待测小麦具有或候选具有Hap-6B-1型的小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型,鉴定完毕;若所得酶切产物1不含有1361bp的DNA片段,则所述待测小麦不具有或候选不具有Hap-6B-1型的小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型,继续如下步骤(2);
(2)如下b1)和b2):
b1)以所述待测小麦的基因组DNA为模板,采用所述引物对2和所述引物对3进行PCR扩增,得到PCR产物2;
b2)根据步骤b1)所得的PCR产物2,按照如下方法确定所述待测小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型:若所得PCR产物2含有652bp的DNA片段,则所述待测小麦具有或候选具有Hap-6B-2型的小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型,鉴定完毕;若所得PCR产物2不含有652bp的DNA片段,则所述待测小麦不具有或候选不具有Hap-6B-2型的小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型,继续如下步骤(3);
(3)如下c1)和c2):
c1)以所述待测小麦的基因组DNA为模板,采用所述引物对4进行PCR扩增,得到PCR产物3;再用所述限制性内切酶Hpy166II酶切所述PCR产物3,得到酶切产物2;
c2)根据步骤c1)所得的酶切产物2,按照如下方法确定所述待测小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型:若所得酶切产物2含有248bp的DNA片段,则所述待测小麦具有或候选具有Hap-6B-3型的小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型;若所得酶切产物2含有228bp的DNA片段,则所述待测小麦具有或候选具有Hap-6B-4型的小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型。
4.利用权利要求2所述试剂盒鉴定待测小麦是否具有Hap-6B-1型的小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型的方法,包括如下步骤:
(A1)以待测小麦的基因组DNA为模板,采用权利要求3中所述引物对1进行PCR扩增,得到PCR产物1;再用限制性内切酶BstNI酶切所述PCR产物1,得到酶切产物1;
(A2)根据步骤(A1)所得的酶切产物1,按照如下方法确定所述待测小麦是否具有Hap-6B-1型的小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型:若所得酶切产物1含有1361bp的DNA片段,则所述待测小麦具有或候选具有Hap-6B-1型的小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型;若所得酶切产物1不含有1361bp的DNA片段,则所述待测小麦不具有或候选不具有Hap-6B-1型的小麦粒重基因TaGW2-6B启动子区单元型。
5.根据权利要求3或4所述的方法,其特征在于:采用所述引物对1进行PCR扩增的退火温度为64℃;采用所述引物对2进行PCR扩增的退火温度为61℃;采用所述引物对3进行PCR扩增的退火温度为62℃;采用所述引物对4进行PCR扩增的退火温度为63℃。
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