[发明专利]一种基于生物组学整合技术的水体毒性分析方法

权利要求书

1.一种基于生物组学整合技术的水体毒性分析方法，其步骤如下：

（1）染毒实验：选择受试样品，以纯净水作为空白对照，选取模式动物，进行染毒实验；

（2）样品采集：染毒周期结束后，采集提取肝脏总RNA样品；采集离心得到血清样品；

（3）转录组检测：染毒组和对照组每3个RNA样品混合成1个样品，进行转录组基因芯片检测，每组做3张芯片，进行统计分析，得到受试模式动物全基因组表达数据；

（4）代谢组检测：染毒组和对照组每个模式动物的血清样品，进行核磁共振检测，获得血清核磁共振谱图，最终获得血清代谢物的信号值；

（5）差异表达基因筛选：根据基因芯片的检测结果，将染毒组和对照组基因表达信号进行比较，筛选表达倍数>2.0且错误发现率<0.1的基因作为差异表达基因；

（6）差异表达代谢物筛选：将血清核磁共振谱图进行分段积分，得到的积分数据进行偏最小二乘法-判别分析，选取对PLS-DA模型影响值>1.0且FDR<0.01的代谢物作为差异表达代谢物；

（7）生物学通路识别：针对差异表达基因和代谢物，首先分别进行基于转录组和代谢组的生物学通路分析；然后识别出转录组和代谢组共同发生变化的生物学通路。

2.根据权利要求1所述的一种基于生物组学整合技术的水体毒性分析方法，其特征在于，所述步骤（6）中将血清核磁共振谱图进行分段积分，以0.005ppm为间隔进行分段积分。

3.根据权利要求1所述的一种基于生物组学整合技术的水体毒性分析方法，其特征在于，所述步骤（7）中，所述基于转录组和代谢组的生物学通路分析，具体为筛选超几何检验p<0.05且包含4个以上差异表达基因的通路被识别为基于转录组受到显著影响的通路，通路影响值>0.1的通路被识别为基于代谢组受到显著影响的通路；转录组和代谢组均发生变化的生物学通路作为最终识别的显著变化的生物学通路，指示了检测水体毒性作用影响的具体生物学过程，相应的差异表达基因和代谢物可作为判断水体毒性的生物标志物。

4.根据权利要求1所述的一种基于生物组学整合技术的水体毒性分析方法，其特征在于，所述代谢组检测：将染毒组和对照组血清样品，加入pH7.4的磷酸盐缓冲液混合均匀后取上清液，进行核磁共振检测。