[发明专利]用于与KRAS基因杂交的DNA探针库及采用其富集KRAS基因片段的方法有效
| 申请号: | 201310429758.2 | 申请日: | 2013-09-18 |
| 公开(公告)号: | CN103667267A | 公开(公告)日: | 2014-03-26 |
| 发明(设计)人: | 邵阳 | 申请(专利权)人: | 邵阳 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C40B40/06;C12N15/10;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京瑞恒信达知识产权代理事务所(普通合伙) 11382 | 代理人: | 曹津燕;张伟 |
| 地址: | 333100 江西*** | 国省代码: | 江西;36 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 kras 基因 杂交 dna 探针 采用 富集 片段 方法 | ||
1.一种用于与KRAS基因杂交的DNA探针库,其特征在于,所述DNA探针库包括一个或多个能够与KRAS基因杂交的DNA探针,所述DNA探针包含以下序列:
SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9、或SEQ IDNO.10;
优选地,所述DNA探针的序列如以下序列所示:
SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9、或SEQ ID NO.10。
2.一种富集KRAS基因片段的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
1)获得受试者的DNA样本库;
2)获得能够与KRAS基因杂交的DNA探针库;
3)使所述DNA探针库与所述DNA样本库进行杂交;和
4)分离步骤3)的杂交产物,然后释放经杂交富集的KRAS基因片段。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述步骤1)中的DNA样本库由双链DNA片段组成,并且,所述步骤1)包括:
1-1)提取受试者的全基因组DNA,然后将其片段化;或者
1-2)提取受试者的mRNA,将其片段化,然后以该经片段化的mRNA为模板合成双链cDNA;
其中,所述受试者为哺乳动物,优选人,且从受试者的细胞、组织或体液样本中提取全基因组DNA或mRNA;
优选地,所述DNA片段的长度为150-600bp;
进一步优选地,所述DNA片段的长度为150-200bp。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其特征在于,所述步骤2)中的DNA探针库为根据权利要求1所述的DNA探针库。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其特征在于,所述步骤3)包括:
3-1)采用选择性标记标记DNA探针库中的DNA探针;和
3-2)使所述DNA探针库与DNA样本库进行杂交;
优选地,所述步骤3-1)中的选择性标记为生物素;
进一步优选地,所述步骤3-2)包括在PCR扩增仪中,在65℃下将所述DNA探针库与DNA样本库孵育24小时。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其特征在于,所述步骤4)中利用DNA探针上的选择性标记分离杂交产物;
优选地,所述步骤3-1)中的选择性标记为生物素,所述步骤4)中利用链霉亲和素-生物素的亲和作用分离杂交产物。
7.一种检测KRAS基因的基因结构突变的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
1)根据权利要求1至6中任一项所述的方法富集KRAS基因片段;和
2)检测所述KRAS基因的基因结构突变。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述步骤2)中采用下一代测序技术,通过对富集到的KRAS基因片段进行测序而检测所述KRAS基因的结构突变。
9.一种用于富集KRAS基因片段的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含根据权利要求1所述的DNA探针库。
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