[发明专利]一种内含子来源环形RNA分子及其成环关键核酸序列的应用有效
申请号: | 201310398809.X | 申请日: | 2013-09-05 |
公开(公告)号: | CN104419704A | 公开(公告)日: | 2015-03-18 |
发明(设计)人: | 陈玲玲;杨力;张杨;张晓鸥 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海生命科学研究院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/10 |
代理公司: | 上海光华专利事务所 31219 | 代理人: | 张艳 |
地址: | 200031 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 内含 来源 环形 rna 分子 及其 关键 核酸 序列 应用 | ||
1.一种成环关键核酸序列元件,包括5’成环基序和3’成环基序,所述5’成环基序包含7个碱基组成的GU-rich元件;所述3’成环基序包含11个碱基组成的C-rich元件;所述5’成环基序的第一个碱基与所述3’成环基序的最后一个碱基通过2’-5’磷酸二酯键连接。
2.如权利要求1所述的成环关键核酸序列元件,其特征在于,所述GU-rich元件中,鸟嘌呤和尿嘧啶总量占5’成环基序碱基总量的57%~100%;所述C-rich元件中,胞嘧啶总量占3’成环基序碱基总量的27%~64%;该百分比为数量百分比。
3.如权利要求1所述的成环关键核酸序列元件,其特征在于,所述ANKRD52基因内含子来源的环形RNA ci-ankrd52中,所述5’成环基序如SEQ ID NO:71所示;所述3’成环基序如SEQ ID NO:72所示;所述内含子来源的环形RNA ci-ankrd52序列如SEQ ID NO:69所示。
4.权利要求1-3任一权利要求所述成环关键核酸序列元件在诱导非环形结构RNA成环中的应用。
5.一种内含子来源环形RNA,为环状的单链RNA结构,含有权利要求1-3任一权利要求所述成环关键核酸序列元件。
6.如权利要求5所述内含子来源环形RNA,其特征在于,在所述内含子来源环形RNA尚未成环以前的线性内含子RNA中,所述5’成环基序位于该线性内含子RNA的5’端,并且所述5’成环基序的第一个碱基为线性内含子RNA的5’端的第一个碱基;在成环过程中,所述5’成环基序的第一个碱基通过2’-5’磷酸二酯键与所述3’成环基序中最后一个碱基连接;并且连接后,3’成环基序最后一个碱基后面的序列降解,从而获得所述内含子来源环形RNA。
7.如权利要求5所述内含子来源环形RNA,其特征在于,该环形RNA的长度为200nt~3000nt。
8.一种诱导线性RNA分子成环的方法,为将权利要求1-3任一权利要求所述成环关键核酸序列元件中的所述5’成环基序和3’成环基序分别替换到非环形结构RNA分子两端,即可诱导其成环。
9.权利要求1-3任一权利要求所述成环关键核酸序列元件,权利要求5-7任一权利要求所述环形内含子RNA,及权利要求8所述诱导线性RNA分子成环的方法在核酸研究领域的应用。
10.如权利要求9所述的应用,其特征在于,所述应用为在RNA分子的重构和/或RNA功能研究领域的应用。
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