[发明专利]一种常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测方法无效
| 申请号: | 201310364468.4 | 申请日: | 2013-08-20 |
| 公开(公告)号: | CN103436611A | 公开(公告)日: | 2013-12-11 |
| 发明(设计)人: | 徐鹏;刘园园;刘晓勇;孙效文 | 申请(专利权)人: | 徐鹏 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京远大卓悦知识产权代理事务所(普通合伙) 11369 | 代理人: | 史霞 |
| 地址: | 100143 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 常见 鲟鱼 pcr rflp 快速 检测 方法 | ||
1.一种常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测用试剂盒,其特征在于,包括:
引物对
PCR常规试剂:Taq DNA聚合酶、10×buffer PCR缓冲液、MgCl2和dNTPs;
以及酶切试剂:10×buffer酶切缓冲液、100×BSA和限制性内切酶Nae1。
2.如权利要求1所述常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测用试剂盒,其特征在于,所述引物对为:
上游引物,其为SEQ ID No.1所示的多核苷酸序列;
下游引物,其为SEQ ID No.2所示的多核苷酸序列。
3.一种常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测方法,其特征在于,使用权利要求2所述试剂盒用于常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测方法,包括以下步骤:
步骤一,提取待检测样品的基因组DNA作为模板;
步骤二,将所述基因组DNA使用所述试剂盒包含的试剂和所述引物对配制成PCR体系,配制成的PCR体系放入PCR扩增仪中进行PCR扩增,反应完成之后,将PCR产物放入4℃保存备用;
步骤三,用限制性内切酶酶切所述PCR产物,获得酶切产物;
步骤四,将所述PCR产物和所述酶切产物跑琼脂糖凝胶电泳,根据电泳图进行物种鉴定。
4.如权利要求3所述的常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测方法,其特征在于,所述PCR扩增反应的反应体系为15μl:即为在200μl PCR反应管中加入0.1μl浓度为2,500units/mL的Taq DNA聚合酶,1.5μl10×buffer PCR缓冲液,1.5μl25mM MgCl2,1.2μl浓度为10pm/μl的dNTPs,2μl所述基因组DNA,0.5μl浓度为10pm/μl的所述上游引物,0.5μl浓度为10pm/μl的所述下游引物和7.7μl无菌水。
5.如权利要求3所述的常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测方法,其特征在于,所述PCR扩增反应的反应条件为94℃预变性5min,然后94℃变性30s、58℃退火30s、72℃延伸45s,从预热、退火到延伸共反应35个循环,然后72℃延伸10min。
6.如权利要求3所述的常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测方法,其特征在于,所述酶切反应的反应体系为20μl:即为在200μl PCR反应管中加入1μg所述PCR产物,2μl10×buffer酶切缓冲液,0.2μl100×BSA,0.5μl限制性内切酶Nae1和加无菌水至20μl,然后将所述酶切反应体系在37℃温育反应1h,65℃热失活20min。
7.如权利要求3所述的常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测方法,其特征在于,所述常见鲟鱼种类为中华鲟、施氏鲟、西伯利亚鲟、小体鲟、达氏鳇、欧煌、闪光鲟和俄罗斯鲟。
8.如权利要求7所述的常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测方法,其特征在于,所述常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测方法可用于区分欧煌与中华鲟、施氏鲟、小体鲟、达氏鳇、西伯利亚鲟、闪光鲟或俄罗斯鲟中任一种。
9.如权利要求8所述的常见鲟鱼类的PCR-RFLP快速检测方法,其特征在于,所述限制性内切酶Nae1酶切位点为中华鲟、施氏鲟、西伯利亚鲟、小体鲟、达氏鳇、闪光鲟或俄罗斯鲟所述PCR产物中多核苷酸序列5`的350和351个碱基之间的磷酸二酯键,欧煌没有所述酶切位点,中华鲟、施氏鲟、西伯利亚鲟、小体鲟、达氏鳇、欧煌、闪光鲟和俄罗斯鲟所述PCR产物中扩增多核苷酸序列分别为SEQ ID No.3、SEQ ID No.4、SEQ ID No.5、SEQ ID No.6、SEQ ID No.7、SEQ ID No.8、SEQ ID No.9和SEQ ID No.10所示序列。
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