[发明专利]具有修饰的序列的呼肠孤病毒

说明书

本申请为分案申请，原申请的申请日为2008年3月11日，申请号为200880007670.9(PCT/CA2008/000483)，发明名称为“具有修饰的序列的呼肠孤病毒”。

相关申请的交叉引用

根据35U.S.C.119(e)，本申请要求2007年3月12日提交的美国申请第60/894,425号和2007年11月21日提交的美国申请第60/989,568号的优先权，这两者通过引用并入本文。

技术领域

本发明涉及病毒，更具体地涉及具有修饰的序列的呼肠孤病毒。

背景

呼肠孤病毒的名称来自呼吸和肠孤儿病毒的首字母缩写，代表来自人类呼吸和肠道但不与严重疾病关联的最初分离株(isolate)。呼肠孤病毒具有双链、节段的RNA基因组。病毒体的直径经测量为60-80nm并具有两层各自为二十面体的同心的衣壳。哺乳动物呼肠孤病毒基因组由10个不连续区段的双链RNA组成，总基因组大小为～23.5kbp。单独RNA区段的大小不同。

已经从哺乳动物物种回收三种血清学上不同但相关类型的呼肠孤病毒：1型(代表性毒株包括例如，Lang(T1L))、2型(代表性毒株包括例如，Jones(T2J))和3型(代表性毒株包括例如，Dearing或Abney(分别是T3D或T3A))。这三种血清型基于中和和血凝素抑制测定是易于鉴定的(参见例如，Sabin，1959，Science，130：966；Fields等人，1996，Fundamental Virology，第3版，Lippincott-Raven；Rosen，1960，Am.J.Hyg.，71：242；和Stanley，1967，Br：Med.Bull.，23：150)。

概述

本文提供了具有修饰的核酸和多肽序列的呼肠孤病毒。序列修饰包括，例如在呼肠孤病毒一种或多种基因组区段中的修饰。还提供了包括具有修饰的序列的呼肠孤病毒的药物组合物以及使用这种呼肠孤病毒的方法。

一方面，本发明提供具有如下多肽的呼肠孤病毒：具有一种或多种氨基酸修饰的λ-3多肽；具有一种或多种氨基酸修饰的σ-3多肽；具有一种或多种氨基酸修饰的μ-1多肽；和/或具有一种或多种氨基酸修饰的μ-2多肽。这种呼肠孤病毒可为例如，非天然产生的。另一方面，本发明提供具有一种或多种氨基酸修饰的呼肠孤病毒λ-3多肽；具有一种或多种氨基酸修饰的呼肠孤病毒σ-3多肽；具有一种或多种氨基酸修饰的呼肠孤病毒μ-1多肽；和/或具有一种或多种氨基酸修饰的呼肠孤病毒μ-2多肽。

以示例的方式，λ-3多肽中的一种或多种氨基酸修饰可为相对于GenBank登记号M24734.1编号的残基214处的Val、残基267处的Ala、残基557处的Thr、残基755处的Lys、残基756处的Met、残基926处的Pro、残基963处的Pro、残基979处的Leu、残基1045处的Arg、残基1071处的Val或其任何组合。注意到，当氨基酸序列在残基214处是Val或在残基1071处是Val时，氨基酸序列进一步包括氨基酸序列中的至少一种另外的改变。在一实施方案中，λ-3多肽包括SEQ ID NO：19中所示的序列。

进一步以示例的方式，σ-3多肽中的一种或多种氨基酸修饰可为相对于GenBank登记号K02739编号的残基14处的Leu、残基198处的Lys或其任何组合。注意到，当氨基酸序列在残基14处是Leu时，氨基酸序列进一步包括氨基酸序列中的至少一种另外的改变。在一实施方案中，σ-3多肽包括SEQ ID NO：15中所示的序列。

进一步以示例的方式，μ-1多肽中的一种或多种氨基酸修饰可为相对于GenBank登记号M20161.1编号的残基73处的Asp。在一实施方案中，μ-1多肽包括SEQ ID NO：17中所示的序列。

还以示例的方式，μ-2多肽中的氨基酸修饰可为相对于GenBank登记号AF461684.1编号的残基528处的Ser。在一实施方案中，μ-2多肽包括SEQ ID NO：16中所示的序列。