[发明专利]用于检测食物腐败微生物的组合物

说明书

电子提交材料的引入参考

在此将全部引入作为参考的是与此同时提交的并如下标识的计算机可读核苷酸/氨基酸序列表：日期为2012年7月20日的文件名为“710675序列表”的One8,781Byte ASCII（文本）。

发明背景

微生物（例如，细菌）可以在制造过程中或制造后引起食物（例如，啤酒）的腐败。一些微生物可能引起食物腐败以及几种不合需要作用中的任何一种或多种，如，例如，令人不愉快的气味、令人不愉快的味道以及使得食物食用不安全。不能准确且快速地检测食物腐败微生物的存在可能增加食物腐败的风险。引起食物腐败的微生物的快速且准确检测的障碍包括，例如，用于检测微生物的传统微生物学方法的冗长持续时间。这些传统方法可能要花7-14天来完成。准确检测的另一个障碍包括，例如，一些食物腐败微生物的基因组序列与非食物腐败微生物的基因组序列相比的相似性。

因此，对用于检测引起食物腐败的微生物的改进组合物和方法存在需求。

发明简述

本发明的一个实施方案提供了由选自SEQ ID NOs:1-45的核苷酸序列组成的核酸。

本发明的另一个实施方案提供了包含两个或更多个核酸的一组核酸，其中两个或更多个核酸各自由选自SEQ ID NOs:1-45的核苷酸序列组成。

本发明的另一个实施方案提供了包含一组核酸的试验试剂盒，其中那组核酸选自（a）SEQ ID NOs:1-3；（b）SEQ ID NOs:4-6；（c）SEQ ID NOs:7-9；（d）SEQ ID NOs:10-12；（e）SEQ ID NOs:13-15；（f）SEQ ID NOs:16-18；（g）SEQ ID NOs:19-21；（h）SEQ ID NOs:22、24和27；（i）SEQ ID NOs:22、25和27；（j）SEQ ID NOs:23、26和27；（k）SEQ ID NOs:28-30；（l）SEQ ID NOs:31-33；（m）SEQ ID NOs:34-36；（n）SEQ ID NOs:37-39；（o）SEQ ID NOs:40-42；和（p）SEQ ID NOs:43-45。

本发明的再另一个实施方案提供了一种检测食物中一种或多种微生物的存在的方法，该方法包括：（a）获得至少一种包含从食物分离的微生物核酸的测试样品；（b）在允许本发明的核酸和微生物核酸之间形成复合物的条件下，使本发明的核酸、一组核酸或包括至少一种本发明的核酸的支持物与至少一种测试样品接触；（c）检测复合物；和，任选地，（d）将至少一种测试样品中的复合物的量与来自缺乏微生物核酸的阴性样品中的复合物的量相比较，其中增加量的来自所述至少一种测试样品的复合物表示一种或多种微生物的存在。

发明详述

本发明的一个实施方案提供了由选自SEQ ID NOs:1-45的核苷酸序列组成的核酸。在一个实施方案中，核酸是分离的或纯化的。本发明的核酸提供了正向引物、反向引物和探针，有利地，其可以与微生物核酸特异性地杂交，用于检测食物中一种或多种微生物的存在。在一些实施方案中，引物和探针与特定属的微生物的核酸特异性地杂交。在一个特别优选的实施方案中，引物和探针与特定种的微生物的核酸特异性地杂交。

本发明的核酸可以用于检测食物样品中一种或多种引起食物腐败的微生物的存在。在本发明的一个实施方案中，本发明的核酸可以特异性地检测选自片球菌属（Pediococcus）、乳杆菌属（Lactobacillus）、梳状菌属（Pectinatus）和巨球形菌属（Megasphaera）的一个或多个属的一种或更多种微生物。通过本发明的核酸可以特异性地检测的微生物的示例性种列于表1中。

本发明的核酸可以特异性地检测任何类型的微生物核酸。在本发明的一个实施方案中，微生物核酸是DNA。在再另一个实施方案中，本发明的核酸是由与SEQ ID NO:1-45中任一个互补的核苷酸序列组成的核酸。与SEQ ID NO:1-45任一个互补的核酸可以检测微生物RNA。