[发明专利]一种检测儿童哮喘的标志物及引物有效
申请号: | 201310299330.0 | 申请日: | 2013-07-17 |
公开(公告)号: | CN103397088A | 公开(公告)日: | 2013-11-20 |
发明(设计)人: | 蔡欣;徐东刚;徐东群;王金凤;邹民吉;付文亮 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事医学科学院基础医学研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/113;C12N15/11 |
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地址: | 100850*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 儿童哮喘 标志 引物 | ||
技术领域
本发明属于儿童哮喘辅助诊断技术领域,具体涉及一种检测儿童哮喘的标志物及引物。
背景技术
支气管哮喘是当前世界威胁公共健康最常见的慢性肺部疾病,哮喘的发生可影响人类各年龄层,可在婴幼儿起病,并以儿童多发。2009年全球哮喘防治创议(GINA)指出,近20年来各年龄段哮喘发病率明显升高,尤其是儿童。20世纪90年代对我国0~14岁儿童哮喘患病情况的抽样调查显示,我国儿童哮喘患病率为0.11%~2.03%[1],而2000年的调查显示,我国儿童哮喘患病率为0.25%~4.63%,因此,我国儿童哮喘的发病情况同样严峻[2]。哮喘不仅严重危害儿童的健康成长,对其整个一生的生存质量产生远期影响,而且给我国带来沉重的经济损失和社会负担,影响社会稳定和国民经济的可持续发展。
哮喘的病因和发病机制十分复杂,是免疫、遗传和环境因素综合作用的结果。一般认为哮喘在儿童5岁左右有两个发病高峰。临床上大多数患者是从隐匿发病开始,逐渐加重的。儿童因年龄、生理解剖、免疫功能、变应原接触量、环境情况等因素致喘,致喘因素复杂,故儿童哮喘在发作诱因、频度、轻重上不同于成人[3]。儿童哮喘诊断主要有以下几点难点::1、儿童哮喘的诊断需除外其他疾病,但要除外的疾病种类相当庞大,需要临床工作者丰富的工作经验和审慎的工作态度。2、5岁以下的儿童肺功能测定及支气管激发试验难于开展,加大了儿童哮喘的诊断难度。3、对反复喘息的认识有一定难度,如对患儿既往喘息次数的正确掌握应该依据医疗病历记载而并非家长主诉,但在我国许多家 长特别是来自农村的家长对医疗病历保管不当经常遗失,因此对患儿既往喘息情况不得而知。诊断主要依据症状、体征,缺乏诊断方法和指标的金标准。特应性变应原检测、总IgE和特异性IgE的检测、肺功能的检测、支气管舒张试验和支气管激发试验(后3项检查尤其适用于5岁以上儿童)对儿童哮喘的诊断具有重要的作用,但并非所有患儿均具有上述指标异常。
因此,迫切需要更好的早期检测儿童哮喘的方法。哮喘候选基因研究表明基因的多态性特征与儿童哮喘的易感性及哮喘严重程度相关,遗传度为70%~80%,存在显著的种族差异[4-5]。目前报道有25条与哮喘相关的候选基因,其中部分候选基因的SNP与呼吸系统疾病相关,并在呼吸系统中发挥重要作用[6]。通过对哮喘相关候选基因SNP与儿童哮喘易感性的研究,能够为儿童哮喘的诊断、预防与治疗提供技术支撑。因此,对于儿童哮喘的早期诊断及靶向治疗具有重要意义。
GATA3是1993年发现的一种细胞谱系特异性因子,属于GATA转录因子家族[7],是T细胞发育中最重要的转录调节因子之一,已确定它为早期定向的T细胞和双阴性胸腺细胞的发育和存活所必需。Th2细胞因子的转录都需要GATA3的参与。通过反义寡核苷酸特异性阻断GATA3表达可以抑制哮喘小鼠气道炎症、BALF和肺间质中Th2细胞因子的数量和AHR[8]。因此,GATA3在哮喘发病过程中也起着重要作用。但GATA3基因多态性与哮喘的关系还尚未被广泛研究。仅有研究发现GATA3基因多态性在芬兰人群中与伴有高水平IgE的哮喘患者相关[8],而GATA3基因的多态性与德国哮喘儿童没有相关性[9]。这与研究选取的SNP位点均位于基因的内含子区和基因的非翻译区(3’-UTR)可能有关。因此,进一步发现和探讨GATA3基因的多态性与我国儿童哮喘的关联对儿童哮喘的早期诊断及靶向治疗具有重要意义。
发明内容
本发明的目的在于提供所设计的特异性检测GATA3的5’启动子区SNP290G/A位点的引物。
本发明的目的还在于在于提供所设计的检测GATA3的5’启动子区的SNP290G/A位点的靶序列。
本发明通过Haploview4.1下载中国人(CHB+JPT)GATA3基因5’启动子区域SNPs,并参考美国国家生物技术信息中心(NCBI)SNP数据库,设MAF大于5%、r2大于0.8,筛选该基因的标签SNP。选定1个与调控转录活性密切相关的位于GATA3基因5’启动子的SNP290G/A。
一种检测儿童哮喘的标志物,所述标志物为GATA3基因5’启动子的SNP290G/A位点,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,长度为584bp。
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