[发明专利]钝吻黄盖鲽微卫星位点及引物无效
申请号: | 201310216554.0 | 申请日: | 2013-06-03 |
公开(公告)号: | CN103305508A | 公开(公告)日: | 2013-09-18 |
发明(设计)人: | 张岩;潘婷;张辉;姜云荣;隋海东 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院黄海水产研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 龚燮英 |
地址: | 266071 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 钝吻黄盖鲽微 卫星 引物 | ||
技术领域
属于分子生物学DNA标记技术领域,具体涉及钝吻黄盖鲽微卫星位点引物。
背景技术
钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae),隶属鲽科,黄盖鲽属,分布于太平洋西部近海,产于我国黄海和渤海,是重要的鱼类资源。近年来,由于渔业捕捞活动的增加,捕捞技术的提高以及海洋污染导致了钝吻黄盖鲽的产量急剧下降。关于钝吻黄盖鲽的主要研究有同工酶,RAPD,mtDNA和AFLP等分析。至今并没有关于钝吻黄盖鲽SSR标记的开发的相关文献。因此,开发钝吻黄盖鲽微卫星位点,将为钝吻黄盖鲽种质资源分析以及物种保护提供依据。
微卫星标记(or SSRs:simple sequence repeats)是一种广泛应用于科学领域的DNA分子标记,它是由少数核苷酸(1~6个)多次重复的简单序列,其中以双核苷酸的重复最为常见。微卫星的多态性高,提供的遗传信息多,PCR扩增效果重复性好,以及在基因组中分散分布等优点,常用于生物的遗传多样性分析,遗传图谱和亲子育种等。由于微卫星研究所用DNA的数量极少,非损伤性取样或者陈旧样品就能进行有效分析,检测种群的生存力,并且可以用历史标本完成操作,因此,此方法适用于野生钝吻黄盖鲽遗传现状的分析。
发明内容
本发明的目的是提供钝吻黄盖鲽微卫星位点的多态性引物,即提供17个微卫星位点以及多态性引物,为钝吻黄盖鲽的遗传多样性以及种群间亲缘关系的鉴定分析,弥补现有技术的不足。
本发明利用高通量测序技术从钝吻黄盖鲽基因组DNA中筛选出17个微卫星位点。其核苷酸序列分别是SEQ ID NO:1-17。
微卫星序列还包括在严格条件下与上述的核苷酸序列杂交的,包含相同微卫星重复单位的核苷酸序列分子。
本发明微卫星引物是从序列SEQ ID NO:1-17的微卫星两端的侧翼序列上设计的正向、反向引物。
微卫星引物序列分别是SEQ NO:17-51
微卫星位点,位点序列和对应的引物信息如表1:
表1:17个微卫星位点以及引物信息
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