[发明专利]钝吻黄盖鲽微卫星位点及引物无效

专利信息
申请号: 201310216554.0 申请日: 2013-06-03
公开(公告)号: CN103305508A 公开(公告)日: 2013-09-18
发明(设计)人: 张岩;潘婷;张辉;姜云荣;隋海东 申请(专利权)人: 中国水产科学研究院黄海水产研究所
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68
代理公司: 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 代理人: 龚燮英
地址: 266071 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 钝吻黄盖鲽微 卫星 引物
【说明书】:

技术领域

属于分子生物学DNA标记技术领域,具体涉及钝吻黄盖鲽微卫星位点引物。

背景技术

钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae),隶属鲽科,黄盖鲽属,分布于太平洋西部近海,产于我国黄海和渤海,是重要的鱼类资源。近年来,由于渔业捕捞活动的增加,捕捞技术的提高以及海洋污染导致了钝吻黄盖鲽的产量急剧下降。关于钝吻黄盖鲽的主要研究有同工酶,RAPD,mtDNA和AFLP等分析。至今并没有关于钝吻黄盖鲽SSR标记的开发的相关文献。因此,开发钝吻黄盖鲽微卫星位点,将为钝吻黄盖鲽种质资源分析以及物种保护提供依据。

微卫星标记(or SSRs:simple sequence repeats)是一种广泛应用于科学领域的DNA分子标记,它是由少数核苷酸(1~6个)多次重复的简单序列,其中以双核苷酸的重复最为常见。微卫星的多态性高,提供的遗传信息多,PCR扩增效果重复性好,以及在基因组中分散分布等优点,常用于生物的遗传多样性分析,遗传图谱和亲子育种等。由于微卫星研究所用DNA的数量极少,非损伤性取样或者陈旧样品就能进行有效分析,检测种群的生存力,并且可以用历史标本完成操作,因此,此方法适用于野生钝吻黄盖鲽遗传现状的分析。

发明内容

本发明的目的是提供钝吻黄盖鲽微卫星位点的多态性引物,即提供17个微卫星位点以及多态性引物,为钝吻黄盖鲽的遗传多样性以及种群间亲缘关系的鉴定分析,弥补现有技术的不足。

本发明利用高通量测序技术从钝吻黄盖鲽基因组DNA中筛选出17个微卫星位点。其核苷酸序列分别是SEQ ID NO:1-17。

微卫星序列还包括在严格条件下与上述的核苷酸序列杂交的,包含相同微卫星重复单位的核苷酸序列分子。

本发明微卫星引物是从序列SEQ ID NO:1-17的微卫星两端的侧翼序列上设计的正向、反向引物。

微卫星引物序列分别是SEQ NO:17-51

微卫星位点,位点序列和对应的引物信息如表1:

表1:17个微卫星位点以及引物信息

位点微卫星序列正向引物序列反向引物序列PTH1SEQ ID NO:1SEQ ID NO:18SEQ ID NO:19PTH2SEQ ID NO:2SEQ ID NO:20SEQ ID NO:21PTH3SEQ ID NO:3SEQ ID NO:22SEQ ID NO:23PTH4SEQ ID NO:4SEQ ID NO:24SEQ ID NO:25PTH5SEQ ID NO:5SEQ ID NO:26SEQ ID NO:27PTH6SEQ ID NO:6SEQ ID NO:28SEQ ID NO:29PTH7SEQ ID NO:7SEQ ID NO:30SEQ ID NO:31PTH8SEQ ID NO:8SEQ ID NO:32SEQ ID NO:33PTH9SEQ ID NO:9SEQ ID NO:34SEQ ID NO:35PTH10SEQ ID NO:10SEQ ID NO:36SEQ ID NO:37PTH11SEQ ID NO:11SEQ ID NO:38SEQ ID NO:39PTH12SEQ ID NO:12SEQ ID NO:40SEQ ID NO:41PTH13SEQ ID NO:13SEQ ID NO:42SEQ ID NO:43PTH14SEQ ID NO:14SEQ ID NO:44SEQ ID NO:45PTH15SEQ ID NO:15SEQ ID NO:46SEQ ID NO:47PTH16SEQ ID NO:16SEQ ID NO:48SEQ ID NO:49PTH17SEQ ID NO:17SEQ ID NO:50SEQ ID NO:51

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