[发明专利]SACS基因突变体及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及SACS基因突变体及其应用。具体地，本发明涉及分离的核酸、分离的多肽、筛选易感痉挛性共济失调病的生物样品的方法、筛选易感痉挛性共济失调病的生物样品的系统以及用于筛选易感痉挛性共济失调病的生物样品的试剂盒。

背景技术

遗传性痉挛性共济失调（spastic ataxia of the Charlevoix-Saguenay type，SACS）是一种罕见的常染色体隐性遗传的神经退行性疾病，以进行性小脑功能障碍，伴反射亢进痉挛状态的锥体束征及伴肌萎缩的感觉运动性周围神经病为临床表现。SACS病多在1-5岁发病，最初临床表现为行走能力较同龄儿童推迟，步态不稳和频繁跌倒，在发病早中期，构音障碍和痉挛性截瘫是其主要的临床表现，随着病情的发展，下肢的周围神经病变逐渐明显，锥体束征逐渐被日益严重的周围神经病变所掩盖，在疾病的后期常可看到远端肌萎缩、弓形足和槌状趾，而下肢的病理征甚至会被这些症状所掩盖，部分患者可伴发有轻度的智力发育障碍或精神行为异常。病情进展相对缓慢，在发病30-40年后，多数患者需要做轮椅。头颅MRI可显示小脑蚓部萎缩，神经电图和神经活检显示严重的轴性神经病变伴随轻度的脱髓鞘，感觉神经纤维往往较运动神经纤维损伤严重，肌肉活检常可看到组织总线粒体DNA的缺失。

现阶段，寻找致病基因对疾病诊断或治疗意义重大。目前已知SACS为痉挛性共济失调病的致病相关基因，且已发现多个致病基因位点，但仍存在着相当一部分未知致病基因位点。

因而，目前对痉挛性共济失调病的研究仍有待深入。

发明内容

本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本发明的一个目的在于提出一种能够有效筛选易感痉挛性共济失调病的生物样品的方法。

本发明是基于发明人的下列工作而完成的：发明人通过高通量外显子组测序联合候选基因突变验证的方法确定了痉挛性共济失调病的致病基因上的新突变。

根据本发明的第一方面，本发明提出了一种分离的核酸。根据本发明的实施例，与SEQ ID NO：1相比，该核酸具有c.1229delT突变，或者c.5840C>G突变。根据本发明的实施例，发明人确定了SACS基因突变体，这些新突变体与痉挛性共济失调病的发病密切相关，从而通过检测这些新突变体在生物样品中是否同时存在，可以有效地检测生物样品是否易感痉挛性共济失调病。

根据本发明的第二方面，本发明提出了一种分离的多肽。根据本发明的实施例，与SEQ ID NO：2相比，该分离的多肽具有p.Leu410X突变，或者p.Pro1947Arg突变。通过检测生物样品中是否同时表达上述多肽，可以有效地检测生物样品是否易感痉挛性共济失调病。

根据本发明的第三方面，本发明提出了一种筛选易感痉挛性共济失调病的生物样品的方法。根据本发明的实施例，该方法包括以下步骤：从生物样品提取核酸样本；确定所述核酸样本的核酸序列；所述核酸样本的核酸序列或其互补序列，与SEQ ID NO：1相比具有c.1229delT和c.5840C>G的复合杂合突变，是所述生物样品易感痉挛性共济失调病的指示。通过根据本发明实施例的筛选易感痉挛性共济失调病的生物样品的方法，可以有效地筛选易感痉挛性共济失调病的生物样品。

根据本发明的第四方面，本发明提出了一种筛选易感痉挛性共济失调病的生物样品的系统。根据本发明的实施例，该系统包括：核酸提取装置，所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本；核酸序列确定装置，所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连，用于对所述核酸样本进行分析，以便确定所述核酸样本的核酸序列；判断装置，所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连，以便基于所述核酸样本的核酸序列或其互补序列，与SEQ ID NO：1相比具有c.1229delT和c.5840C>G的复合杂合突变，判断所述生物样品是否易感痉挛性共济失调病。利用该系统，能够有效地实施前述筛选易感痉挛性共济失调病的生物样品的方法，从而可以有效地筛选易感痉挛性共济失调病的生物样品。