[发明专利]一种高灵敏度检测和鉴定人多瘤病毒的方法有效

专利信息
申请号: 201310174312.X 申请日: 2013-05-13
公开(公告)号: CN103276107A 公开(公告)日: 2013-09-04
发明(设计)人: 彭俊平;郭军华;金奇 申请(专利权)人: 中国医学科学院病原生物学研究所;郭军华
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93
代理公司: 北京华科联合专利事务所 11130 代理人: 王为
地址: 100176 北京市朝*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 灵敏度 检测 鉴定人 病毒 方法
【权利要求书】:

1.一种可同时检测多种人多瘤病毒的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包含SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.39的多核苷酸。

2.根据权利要求1的试剂盒,其中所述人多瘤病毒包括:BK polyomavirus(BKPyV),、JC polyomavirus(JCPyV)、KI polyomavirus(KIPyV)、WU polyomavirus(WUPyV)、Merkel cell polyomavirus(MCPyV)、Human polyomavirus6(HPyV6)、Human polyomavirus7(HPyV7)、trichodysplasia spinulosa-associated polyomavirus(TSPyV)、Human polyomavirus9(HPyV9)、MW polyomavirus(MWPyV)/Human polyomavirus10(HPyV10)/MX polyomavirus (MXPyV)、STL polyomavirus(STLPyV)和Human polyomavirus12(HPyV12)。

3.根据权利要求1的试剂盒,其中,SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.24为12种人多瘤病毒的正向和反向引物序列;SEQ ID NO.27-SEQ ID NO.38为碱基延伸探针序列;SEQ ID NO.25和SEQ ID NO.26为质控引物序列;SEQ ID NO.39为探针序列。

4.权利要求1的试剂盒的使用方法,其特征在于,每种病毒采用针对VP1基因区序列探针检测,所述方法包括以下步骤:

(1)用一对PCR引物,在引物的5’端带有ACGTTGGATG碱基的任意组合的标签序列,使总长度达到30个碱基以上,以区别于探针;在扩增区域中的保守序列区设计一条单碱基延伸探针,探针的长度为14-28个碱基,在探针的3’末端,允许延伸一个经设计确定的碱基,作为该病毒特异性序列标记,单碱基延伸后总长度不超过29个碱基;

(2)第一次PCR扩增反应,将dUTP/dATP/dGTP/dCTP混合物、UNG酶、Tag酶和多重PCR引物一同加入PCR反应体系中,先进行dUTP的消化,降解PCR扩增产物,然后灭活UNG酶,随后作45个循环PCR扩增,获得待测样本中靶序列扩增产物;

(3)用虾碱性磷酸酶处理,使第一轮反应中剩余dNTP脱磷酸失活;

(4)第二次单碱基延伸扩增,将ddNTPs或类似核酸末端终止剂加入反应体系中,使之在单碱基延伸探针的3’端,延伸一个序列特异性单核苷酸,作分子量标记,扩增200个循环,每个探针的延伸产物之间分子量相差至少20Da;

(5)采用阳离子交换树脂吸附盐离子,纯化延伸反应产物;

(6)纯化后产物采用质谱技术进行分子量检测,根据分子量标记确定待测人多瘤病毒的类型。

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