[发明专利]一个棉花高强纤维主效QTL及其分子标记和应用

权利要求书

1.一个棉花高强纤维主效QTL，其特征在于：主效QTL位点QTL qFS-D3-1，有2个SSR标记与之连锁，由标记NAU/SSR/FS1₁₉₅，JESPR/SSR/FS2₁₂₇定位，并且主效QTL位点QTL qFS-D3-1距离标记NAU/SSR/FS1₁₉₅在0.01～2.39cM，所述的标记NAU/SSR/FS1₁₉₅，JESPR/SSR/FS2₁₂₇分别为：

NAU/SSR/FS1₁₉₅，用序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物NAU3700扩增出长度为195bp的DNA片段；

JESPR/SSR/FS2₁₂₇，用序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物JESPR101扩增出长度为127bp的DNA片段；

该主效QTL位点位于棉花Chr.17（D3）染色体上，以加性遗传效应为主，在高强纤维种质系Prema和陆地棉推广品种86-1进行杂交获得的重组自交系群体中通过多年多点鉴定目标主效QTL位点可解释4.51～17.55%的表型变异，LOD值在3.23和7.09之间。

2.根据权利要求1所述的棉花高强纤维基因主效QTL位点，其特征在于：所述的主效QTL位点QTL qFS-D3-1是通过以下方法获得标记定位的：

①通过高强纤维种质系Prema和陆地棉推广品种86-1进行杂交，通过配制重组自交系进行多年多点的试验并结合分子标记技术进行研究，发现Prema高纤维强度的遗传方式为加性遗传效应为主；

②通过分子标记的基因组扫描，发现在陆地棉Chr.17（D3）染色体上有一个能显著提高棉花纤维强度的基因QTLfs，有2个SSR标记，NAU/SSR/FS1₁₉₅，JESPR/SSR/FS2₁₂₇与之紧密连锁；

③利用NAU/SSR/FS1₁₉₅的引物NAU3700在192个品种的棉花基因组DNA中进行PCR扩增，扩增产物的电泳结果表明共有25个品种扩增出和亲本Prema相同的条带，占13.02%，其中纤维强度在30cN/tex以上的品种有10个品种，占总数的40%，如下所述：国外品种包括美F-18、苏远7235、苏联棉91系、upland、Acala(大铃)B和AcalaSJ-1-9，其中和Prema亲缘关系较近的品种包括Acala(大铃)B和AcalaSJ-1-9；国内的品种主要包括巴州5628、冀A-7-8(33系)、邯郸长绒和中资9196（激光）。

3.权利要求1所述棉花高强纤维基因主效QTL位点的分子标记方法，其特征在于：提取棉花基因组DNA，用序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物NAU3700或序列如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物JESPR101对提取的基因组DNA进行PCR扩增，如果用引物NAU3700扩增出长度为195bp的DNA片段，或者用引物JESPR101JESPR101扩增出长度为127bp的DNA片段则证明权利要求1所述棉花高强纤维基因主效QTL位点的存在。

4.权利要求1所述棉花高强纤维基因主效QTL位点的分子标记，其特征在于：分子标记NAU/SSR/FS1₁₉₅引物NAU3700正向引物如SEQ ID NO.1所示，反向引物如SEQ ID NO.2所示；分子标记NAU/SSR/FS1₁₉₅引物NAU3700正向引物如SEQ ID NO.3所示，反向引物如SEQ ID NO.4所示。

5.权利要求1所述的棉花高强纤维主效QTL位点在选育高强纤维的棉花品种中的应用。

6.权利要求1所述的棉花高强纤维主效QTL位点在快速棉花纤维比强度的分子标记辅助选择中的应用。

7.权利要求4所述的棉花高强纤维主效QTL位点的分子标记在选育高强纤维的棉花品种中的应用。

8.权利要求4所述的棉花高强纤维主效QTL位点的分子标记在快速棉花纤维比强度的分子标记辅助选择中的应用。