[发明专利]一种通过基因型推断中国人群中个体细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4表达状况的方法和系统有效
申请号: | 201310146200.3 | 申请日: | 2013-04-24 |
公开(公告)号: | CN103333947A | 公开(公告)日: | 2013-10-02 |
发明(设计)人: | 石屹;凃政;胡兰;杨栋;贾竟 | 申请(专利权)人: | 公安部物证鉴定中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京同立钧成知识产权代理有限公司 11205 | 代理人: | 王庆龙 |
地址: | 100038 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 通过 基因型 推断 中国 人群 个体 细胞 色素 cyp2d6 cyp3a4 表达 状况 | ||
技术领域
本发明涉及一种推断个体细胞色素酶表达状况的方法和系统,尤其涉及一种通过基因型推断中国人群中个体细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4表达状况的方法和系统。
背景技术
美沙酮自上世纪60年代中期开始用于阿片类毒品依赖性治疗,例如对海洛因依赖者的脱瘾治疗,目前国内外使用的主要方法是美沙酮替代疗法。美沙酮是一种阿片制剂,具有毒性和生理依赖性,可导致服用者双目失明、下肢瘫痪甚至死亡。美国FDA已发出关于美沙酮严重不良反应的警告,国内也有低剂量美沙酮中毒报告,这主要是因为不同个体对于药学的代谢快慢不同以及代谢表型不同,针对不能代谢该药物或者代谢能力差的个体直接施用相同剂量的药物,个体中毒或死亡的危险性不可预估,因此,针对个体基因组多态性与美沙酮药物代谢之间的研究显得尤为重要。
细胞色素酶CYP3A4和CYP2D6是参与美沙酮体内代谢的主要酶类,其结构、功能以及表达量与美沙酮在人体内的代谢密切相关。目前国内外研究人员已经发现编码细胞色素酶CYP3A4和CYP2D6的基因上的一些可能会对酶的结构、功能以及表达量产生影响的SNP位点的突变可能会与美沙酮药物代谢能力不良相关,并且这些与美沙酮药物代谢能力不良相关的SNP位点突变存在明显的种族差异和地域差异。目前的研究报道主要集中于欧美人群,还没有关于中国人群中这两个酶的基因上特定SNP突变位点与个体美沙酮代谢能力之间相关性的报道。
因此,如何有效从基因组水平推断细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4的表达状况,并能为中国人群在临床上美沙酮的个性化给药、个性化戒毒以及法医学上死者的死因推断提供指导成为有待解决的问题。
发明内容
本发明提供一种通过基因型推断中国人群中个体细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4表达状况的方法,所述方法能通过确定待检测个体细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4的基因15个SNP位点的基因型与野生型15个SNP位点的基因型的比较来推断待检测个体细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4的表达状况,能为中国人群个性化施用美沙酮、个性化戒毒以及法医学上死者的死因推断提供指导。
本发明进一步提供了一种SNP复合检测体系,能对待检测个体的所述15个SNP位点进行准确分型,为中国人群中个体细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4表达状况的推断提供准确数据。
本发明还提供了一种用于获得中国人群中个体细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4表达状况的系统,所述系统采用上述SNP复合检测体系,在准确分型的基础上准确推断中国人群中个体的细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4表达状况。
本发明还提供了一种用于推断中国人群个体药物代谢能力的系统,所述系统采用上述SNP复合检测体系,在准确分型的基础上准确推断中国人群中个体对药物的代谢能力。
本发明提供的一种通过基因型推断中国人群中个体细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4表达状况的方法,包括:
检测待检测个体的DNA获得其细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4基因的15个SNP位点的基因型;
将获得的待检测个体的15个SNP位点的基因型与野生型细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4基因的15个SNP位点的基因型进行比较,获得基因型差异结果;
根据所述基因型差异结果对个体细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4表达状况进行推断;
所述15个SNP位点为:rs4646440,rs28624811,rs4646437,rs28670611,rs9623561,rs12169962,rs5758589,rs28371759,rs3735451,rs2246709,rs2404955,rs1065852,rs28572577,rs12333983,rs5751222。
在本发明的方案中,所述细胞色素酶CYP2D6和CYP3A4的表达状况包括酶的结构、酶的功能以及酶的表达量。
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