[发明专利]院内感染多病原体并行检测基因芯片及其制作方法和应用

说明书

（一）        技术领域

    本发明属于分子生物学技术及临床检测技术领域，特别涉及一种院内感染多病原体并行检测基因芯片及其制作方法和应用。

（二）        背景技术

近年来，随着医学的发展，院内感染率呈上升趋势，已经引起世界各国医院的重视，因此，对院内感染提出监控措施已成为一项综合性研究课题。国外先进国家早我国30年开展院内感染的研究，我国院内感染率为9％～20％，我国各级卫生行政部门极为重视，卫生部仅用3年时间建立了全国134所医院参加院内感染监控网络，并将院内感染监测标准列入医院分极管理的实施中，利用管理监测的手段推动院内感染特色分析检测等标准。

对院内感染而言，医院现有的诊断技术多靠细菌或病毒培养，培养需要时间，通常是一天或几天，所以一般医生都不等培养结果出来就经验性地用药。这样做的结果是有50％以上的用药都不准确，延误真正的治疗时间，使病人住院时间不必要地延长，增加了医疗成本。     可是这种“事后诸葛亮”式的诊断还不得不做，因为如果医生不开单做培养，那误诊误治产生的医疗事故就由医院和医生负责任。所以感染科医生开诊断实验单的时候很无奈，开了，对这个病人没有真正的帮助，仅仅是为了在医疗档案里面记录一笔，以防今后被告和医疗纠纷，这叫做“Defensive medicine或“防守医学”，不是主动进攻疾病，而是预防病人告医生。这种类型的诊断不但不能减低医疗费用，反而让费用不断增高。     落后的诊断技术是医疗费用持续增长的原因，而新的更快更准的分子鉴别诊断技术则可以让医院降低成本，也给整个社会降低医疗消耗，减少法律纠纷。

iCubate技术平台集核酸提取、扩增和检测三个步骤于一体，而且提供了多重、自动、封闭（防污染）这三个临床迫切需要的关键功能，避免污染而导致的假阳性。使用这个技术平台，一个多个靶点的分子诊断可以在一个小时到一个半小时内完成。

把院内感染的检测放到iCubate技术平台上来，可以做到一个标本，一个反应，多个指标。这样就能知道病人是否有合并感染，是否是其它病原体感染，是否有耐药性，应用到临床上，可以指导临床医生决定病人是否该用或者用哪种抗菌素，对临床的指导意义就更大。

（三）        发明内容

    本发明为了弥补现有技术的不足，提供了一种检测快速灵敏、准确性高的院内感染多病原体并行检测基因芯片及其制作方法和应用。

本发明是通过如下技术方案实现的：

一种院内感染多病原体并行检测基因芯片，主要由固定有相关病原体特异性探针的基因芯片、特异性引物及通用引物组成，其特征在于：所述相关病原体包括鲍式不动杆菌、金黄色葡萄球菌、绿脓假单胞菌、肺炎杆菌、粪肠球菌、屎肠球菌、大肠杆菌、阴沟肠杆菌、奇异变形杆菌、白色念珠菌、克鲁斯念珠菌、光滑假丝酵母、近平滑念珠菌和热带念珠菌共14种病原体，另外还包括一个甲氧西林抗性靶点；所述基因芯片是点阵并固定有上述15种病原体特异性探针，所述特异性引物能对上述15种病原体靶基因进行特异性扩增；所述通用引物是上述15种病原体靶基因无关的核酸序列，其中反向通用引物5’端带有荧光标记。

本发明可以一次反应同时对鲍氏不动杆菌、阴沟肠杆菌、粪肠球菌等14 种医疗感染典型病原体进行快速、灵敏的检测，提供传统扩增方法无法提供的酵母和细菌共感染的检测数据，另外还包括一个甲氧西林抗性靶点，从而可以进一步实现对葡萄球菌感染的检测，这样可以让临床医生在一两个小时内就能知道病人是何种病原体感染，有没有耐药性，从而决定病人是否该用或者用哪种抗菌素，对临床的指导意义就更大。

可检测病原体指标如下：

所述基因芯片中的15种探针为：

鲍氏不动杆菌：5’—AAG TGT AGC TCA TCT TGA AG—3’；

金黄色葡萄球菌：5’—ACT TAA TGA CTC TCA AGC T—3’；

绿脓假单胞菌：5’—ACT CCA CCG A CT CGA TCG TC—3’；

肺炎杆菌：5’—ACG TGC TGC CCG CCT ATG AA—3’；

粪肠球菌：5’—TTA ATA TTT TAA ACA AAG AT—3’；

屎肠球菌：5’—ATG ATA TTG AGT TAG ATG AA—3’；

大肠杆菌：5’—AGG TTA AAG CGA CTG AGG TC—3’；