[发明专利]一种可被猪物种NF-κB转录因子所识别的DNA片段、重组载体及其应用有效
申请号: | 201310073746.0 | 申请日: | 2013-03-08 |
公开(公告)号: | CN103205426A | 公开(公告)日: | 2013-07-17 |
发明(设计)人: | 李和刚;赵金山;阮进学;江科;侯乐乐;郝小静;李培培;张宝珣 | 申请(专利权)人: | 青岛市畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/63;C12N5/10;C12Q1/68 |
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地址: | 266100 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 可被猪 物种 nf 转录 因子 识别 dna 片段 重组 载体 及其 应用 | ||
技术领域
本发明属于动物基因工程领域,具体而言,涉及一种可被猪物种NF-κB转录因子所识别的DNA片段、重组载体及其应用。
背景技术
NF-κB信号通路在猪抗病免疫反应中起着至关重要的作用。NFκB存在于绝大多数类型的组织和细胞,是一类非常关键的转录因子,并组成转录因子NFκB家族(Ghosh et al.,1998;Miyamoto and Verma,1995;Siebenlist et al.,1994),哺乳动物中此家族的五位成员分别是:NFκB1(p50),NFκB2(p52,p49,p50B),RelA(p65),c-Rel,RelB。所有成员都含有一个保守的由300个左右氨基酸组成的Rel同源区,该同源区是NFκB蛋白特有的功能域,负责形成二聚体,并与DNA识别位点及抑制蛋白IκB(inhibitor κB)结合(Baeuerle and Henkel,1994;Perkins,2007)。哺乳类动物中IκB家族成员有7个,分别是IκBα,IκBβ,IκBγ,IκBε,Bcl-3,p100和p105。通常情况下,NFκB家族是以同源或异源二聚体形式与IκB蛋白形成复合物,以非活性形式存在于细胞质中。关于IκB蛋白与NFκB亚单位结合后阻止NFκB与靶基因调控区结合的机理业已阐明(Brasier,2006;DiDonato et al.,1996;Kl ement et al.,1996):当IκB蛋白与NFκB p65亚基结合时,使p65的空间构象改变,p65亚基Ig样结构域的氨基末端旋转180°,从而使与靶DNA序列结合的关键氨基酸残基被屏蔽,从而抑制NFκB与靶基因调控区的特异性结合。而IκB蛋白N端第32、36位丝氨酸残基从NFκB-IκB复合物中位置凸出,极易被IκB蛋白激酶(IκB kinase,IKK)磷酸化,磷酸化的IκB进一步被蛋白酶体泛素化降解,使NFκB激活,从NFκB-IκB复合物中解离出并转位于细胞核,与相应的靶基因结合。但同时IκB在被降解后又可迅速再合成,并能进入细胞核与NFκB结合,而NFκB-IκB复合物的形成使NFκB从其所结合的DNA位点上脱离,并重新转移至细胞质,由此实现NFκB激活与失活的循环,完成NFκB作为一种转录因子的调控功能。
目前国际学术界普遍采用知名生物技术公司(如Stratagene和Clontech)开发的商业化人用NF-κB报告载体作为各个哺乳动物中通用的研究工具,但其中所隐含的问 题仍不容忽视,原因在于:在不同的物种中,NF-κB转录因子所识别并结合的特异DNA序列不尽相同,因此人用NF-κB报告载体所得数据的灵敏性和稳定性不一定能够满足研究者的要求。如果能够开发出一套适用于猪的NF-κB报告系统,则可为猪的免疫学研究提供更为精细、可靠的工具。
发明内容
鉴于现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种可被猪物种NF-κB转录因子所识别的DNA片段和重组载体,以及该DNA片段作为调控猪物种NF-κB信号通路下游基因表达的启动子的应用、该重组载体作为检测猪物种NF-κB转录因子转录活性强度的报告载体的应用。
本发明提供的DNA片段是由猪物种的多个NF-κB结合位点按不同顺序排列而成的核苷酸序列,并且具有启动子活性。本发明中的术语“启动子”系指DNA上一段序列,RNA聚合酶结合到该序列上,可以起始基因的转录。
具体地,本发明的第一个目的是这样实现的:
一种可被猪物种NF-κB转录因子所识别的DNA片段,其核苷酸序列是如下(1)或(2):
(1)序列表中序列1、序列2、序列3、序列4、序列5或序列6所示的核苷酸序列;
(2)与所述(1)的核苷酸序列具有90%以上同源性且具有启动子活性的核苷酸序列。
本发明的DNA片段还包括与来自序列1、序列2、序列3、序列4、序列5或序列6所示的核苷酸序列互补的核苷酸序列。这里使用的术语“互补的”系指遵循碱基配对原则产生的之意。
本领域普通技术人员可以很容易地采用已知的方法,例如定向进化和点突变的方法,对本发明的启动子核苷酸序列进行突变。那些经过人工修饰的,具有与本发明分离得到的启动子核苷酸序列90%或者更高同源性的核苷酸,只要保持了表达靶基因的启动子活性,均是衍生于本发明的核苷酸序列并且等同于本发明的序列。
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