[发明专利]Leber病之线粒体T3866C检测试剂盒及应用有效

专利信息
申请号: 201310069330.1 申请日: 2013-03-05
公开(公告)号: CN103173544A 公开(公告)日: 2013-06-26
发明(设计)人: 蒋萍萍;管敏鑫;冀延春;梁敏;张娟娟;徐静 申请(专利权)人: 浙江大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 杭州求是专利事务所有限公司 33200 代理人: 张法高;赵杭丽
地址: 310027 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: leber 线粒体 t3866c 检测 试剂盒 应用
【权利要求书】:

1.一种Leber病之线粒体T3866C检测试剂盒,其特征在于,由置于盒体(8)内的DNA提取混合液(1)、扩增T3866C的PCR混合液(2)、针对T3866C设计的一对外引物(3)、针对T3866C设计的一对内引物(4)、限制性内切酶(5)、阳性对照(6)和阴性对照(7)构成,其中DNA提取混合液(1)由细胞裂解液和溶液Ⅰ组成,扩增T3866C的PCR混合液由脱氧单核苷酸、10×PCR缓冲液、MgCl2、三蒸水和DNA聚合酶组成,针对T3866C设计的一对外引物有外前向引物F: TACTTCACAAAGCGCCTTCC和外反向引物R: AAGGATTATGGATGCGGTTG,针对T3866C设计的一对内引物有内前向引物F: CAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCAT CATGACCCTTGGCCATAATATGATAGA和内反向引物R: GAGAGTGCGTCATATGTTGTTCCT AGGAAGA,限制性内切酶为限制性内切酶BglⅡ,阳性对照(6)是含有线粒体序列第3866位点发生T>C突变的酶切样本,阴性对照(7)是不含有线粒体序列第3866位点发生T>C突变的酶切样本,溶液Ⅰ的成分是蛋白酶K。

2.根据权利要求1所述的一种Leber病之线粒体T3866C检测试剂盒,其特征在于,在扩增T3866C的PCR混合液(2)中添加0.1-0.2μl二甲基亚砜。

3.根据权利要求1或2所述的一种Leber病之线粒体T3866C检测试剂盒在检测与母系遗传原发性Leber氏病相关的线粒体基因ND1T3866C突变中的应用。

4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,通过以下步骤实现:

(1)基因组DNA的提取:运用蛋白酶K消化裂解法,从少量的血液标本、带毛囊的毛发、口腔粘膜刮片或唾液的样本中提取基因组DNA;

(2)特异性PCR扩增:使用Primer 5.0软件和Oligo7.0软件根据SEQ ID NO:5所示的人类线粒体基因序列所设计的引物F/R、F/R是能扩增出包含上述原发性Leber氏病的线粒体突变位点的片段,F外/R外扩增出为线粒体DNA的核苷酸3150-4679,其序列为序列表中的SEQ ID NO:1、2;F/R扩增出为线粒体DNA的核苷酸3806-4058,其序列为序列表中的SEQ ID NO:3、4;

(3)酶切鉴定:将上述PCR产物用限制性内切酶BglⅡ对T3866C突变位点处进行酶切;

(4)突变检测:聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,直接根据酶切PCR产物产生的DNA片段数量及DNA片段大小,检测mtDNA是否发生T3866C突变。

5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,步骤(1)所述从血标本、带毛囊的毛发、口腔粘膜刮片或唾液的样本中快速提取基因组DNA,通过以下方法获得:

(1)血标本:取20~200μl血标本或1cm2的血滤纸片放入1.5ml离心管,加入900μl红细胞裂解缓冲液,20mmol/L三羟甲基氨基甲烷-盐酸缓冲液,pH 7.6,室温静置10min,充分裂解红细胞,12000rpm离心1min,收集白细胞沉淀;

(2)带毛囊的毛发:用体积比70%乙醇洗带毛囊的毛发1 次,后再用蒸馏水冲洗毛发2次,在1.5ml离心管中分别放入2~4 根毛发,毛囊置于离心管底部,用干净的剪刀剪去毛发高于离心管的部分;

(3)口腔粘膜刮片或唾液:收集唾液前,必须让被收集者漱口,以除去口腔中过多的老化细胞、食物残渣、牙膏、咖啡、烟等物质,半小时内不要喝水、进食、吸烟,然后开始收集口腔粘膜刮片或唾液,选择如下方法收集唾液样本:①舌头围绕口腔刮取粘膜细胞,将约0.1ml唾液直接吐进EP管内;②生理盐水漱口,吐进离心管内,吸取PBS溶液至装有通过上述任一种方法收集的唾液样本的离心管中,反复吹打后,12000rpm离心5min,除去上清,重复该过程一次;③用棉拭子反复刮拭面颊内壁6次,空气中干燥,然后用灭菌过的镊子小心撕去其外表面,放入离心管中;④将唾液吐在滤纸上,空气中干燥后形成唾液斑,再用干净的剪刀剪成大小约1cm2碎纸片置于离心管中;

然后用细胞裂解液和蛋白酶K对上述样本进行消化裂解,利用盐析法去除杂质,异丙醇沉淀DNA,最后用高压灭菌水或TE缓冲液溶解后于-20℃保存备用。

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