[发明专利]一种推断未知来源个体汉、藏、维群体来源的方法和系统有效

专利信息
申请号: 201310056616.6 申请日: 2013-02-22
公开(公告)号: CN103146820A 公开(公告)日: 2013-06-12
发明(设计)人: 李彩霞;魏以梁;胡兰;季安全;贾竟;李万水 申请(专利权)人: 公安部物证鉴定中心
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京同立钧成知识产权代理有限公司 11205 代理人: 张红莲
地址: 100038 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 推断 未知 来源 个体 群体 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种推断未知来源个体汉、藏、维群体来源的方法,该方法包括:

检测未知来源个体的DNA获得其94个汉、藏、维群体特异性位点的基因型;

获得所述未知来源个体的各特异性位点分别在汉、藏、维群体中的基因型频率;

将所述各特异性位点的基因型频率相乘得到94个特异性位点的分别在汉、藏、维群体中的匹配概率值;

所述匹配概率值最高的群体为未知来源个体的来源群体,

所述94个汉、藏、维群体特异性位点为:rs11652805、rs37369、rs13419896、rs9522149、rs2024566、rs1871428、rs4891825、rs11725412、rs2899826、rs4984913、rs4908343、rs1471211、rs4717865、rs192655、rs4741658、rs6979076、rs12075、rs3785181、rs1994859、rs12913832、rs7238445、rs129014504、rs3915736、rs6010138、rs855791、rs5768007、rs9319336、rs2247445、rs2835370、rs2070586、rs647325、rs2532060、rs316598、rs4953388、rs6998293、rs6422347、rs7416743、rs4719711、rs1325502、rs1407434、rs385194、rs228918、rs842639、rs6520015、rs12682455、rs11064983、rs1800414、rs4463276、rs3943253、rs2001907、rs4458655、rs961154、rs731257、rs9530435、rs10491265、rs9383760、rs1491238、rs17582830、rs11676473、rs7803075、rs1471939、rs10839880、rs1040404、rs7554936、rs6451722、rs10514802、rs39883、rs7844723、rs7589621、rs10512572、rs2564118、rs7583392、rs7997709、rs2306040、rs1569175、rs12629908、rs3118378、rs7421394、rs10002268、rs1408801、rs1513181、rs798443、rs12657828、rs3907047、rs4454698、rs4142654、rs2033111、rs3805322、rs7745461、rs10204096、rs818386、rs6548616、rs10510228、rs9845457。

2.根据权利要求1所述的方法,所述未知来源个体的94个汉、藏、维群体特异性位点的基因型通过DNA测序获得。

3.根据权利要求1所述的方法,所述未知来源个体的94个汉、藏、维群体特异性位点的基因型通过SNP检测复合检测体系获得,所述体系包括94个SNP位点,还包括扩增引物组、微测序引物组以及通用芯片;

所述扩增引物组由与所述94个SNP位点一一对应的94对扩增引物组成,每对扩增引物能扩增待检测DNA上包括其相应的SNP位点的突变型或野生型碱基在内的核苷酸序列;

所述微测序引物组由与所述94个SNP位点一一对应的94条微测序引物组成,每条微测序引物的5’端连有标签序列能与所述通用芯片的标签序列互补,3’端包括与待检测DNA上其相应的SNP位点之前的核苷酸序列互补的序列。

4.根据权利要求3所述的方法,所述扩增引物组为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.188的核苷酸序列;所述微测序引物组为序列表中SEQ ID No.189至SEQ ID No.282的核苷酸序列。

5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述微测序引物5’端连有的标签序列分别为序列表中SEQ ID No.189至SEQ ID No.282的各条核苷酸序列的自5’末端的第1至20位的脱氧核苷酸。

6.根据权利要求1-5任一项所述的方法,其特征在于,所述通用芯片为:微测序反应通用芯片、固相微测序反应芯片或连接酶反应通用芯片。

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