[发明专利]互花米草种群的SNP标记的分型方法无效
| 申请号： | 201310046929.3 | 申请日： | 2013-02-05 |
| 公开（公告）号： | CN103146817A | 公开（公告）日： | 2013-06-12 |
| 发明（设计）人： | 陈建群;丁静;王强;许颖;吴娟子 | 申请（专利权）人： | 南京大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 南京瑞弘专利商标事务所(普通合伙) 32249 | 代理人： | 陈建和 |
| 地址： | 210093 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 互花米草 种群 snp 标记 方法 | ||
1.一种互花米草种群的SNP标记的分型方法，其特征在于，
步骤如下：
1)种群调查及取样；
2)DNA提取；
3)测序；
4)筛选种群的目标基因R71；
5)根据目标基因R71设计引物，正向引物如序列表中SEQ ID NO：1所示；反向引物如序列表中SEQ IDNO：2所示；
6)PCR扩增；
7)测序；
8)序列拼接、比对，鉴定记录单核苷酸多态性位点。
2.根据权利要求1所述的鉴定外来入侵物种互花米草种群的DNA分子标记方法，其特征在于，所述目标基因R71是通过高通量转录组测序后筛选得到。
3.根据权利要求1所述的鉴定外来入侵物种互花米草种群的DNA分子标记方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应条件为：94℃预变性3min，94℃30s、54℃30s、72℃1.5min，39个循环，72℃延伸10min。
4.根据权利要求1所述的鉴定外来入侵物种互花米草种群的DNA分子标记方法，其特征在于，所述目标基因R71在互花米草种群中有8个SNP位点，目标基因R71基因片段如序列表中SEQ ID NO：3所示，其中8个SNP位点分别位于73、117、135、179、224、230、254、616。
5.根据权利要求2所述的鉴定外来入侵物种互花米草种群的DNA分子标记方法，其特征在于，高通量转录组测序的方法：提取样本总RNA，用Oligo(dT)的磁珠富集分离mRNA，合成双链cDNA，构建转录组测序文库，插入片段长度约为500bp,在illumina HiSeq2000测序仪上进行高通量测序，使用Trinity软件对测序片段进行拼接，从而得到基因序列。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于南京大学，未经南京大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201310046929.3/1.html，转载请声明来源钻瓜专利网。
