[发明专利]一种大鲵虹彩病毒LAMP检测试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201310000433.2 | 申请日: | 2013-01-04 |
公开(公告)号: | CN103014181A | 公开(公告)日: | 2013-04-03 |
发明(设计)人: | 曾令兵;孟彦;徐进;张辉;周勇;范玉顶 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院长江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人: | 王敏锋 |
地址: | 430223 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 大鲵 虹彩 病毒 lamp 检测 试剂盒 方法 | ||
技术领域
本发明属于鱼类病毒检测技术领域,具体涉及一种大鲵虹彩病毒LAMP检测试剂盒,还涉及一种利用大鲵虹彩病毒LAMP检测试剂盒检测大鲵虹彩病毒的方法。
背景技术
大鲵(Andrias davidianus)俗称娃娃鱼,属两栖纲、有尾目、隐鳃鲵科、大鲵属,1988年被列为国家二级保护动物,2007年《濒危野生动植物物种国际贸易公约》(CITEJ)第14届缔约国大会被列为Ⅰ类濒危物种。大鲵不仅具有一定的药用和科研价值,而且还可以作为观赏动物和食用佳肴。20世纪80年代以来,我国各地陆续进行了大鲵的人工养殖和繁殖,目前已成为水产养殖中高效养殖的优良品种之一。然而随着养殖规模的扩大,大鲵病害问题日益突出,尤其是近年来暴发的大鲵病毒性出血病,给大鲵养殖业造成了巨大的经济损失,严重制约了其健康养殖的发展。
为了及早发现和确诊大鲵病毒性出血病病原,大鲵虹彩病毒(Giant salamander iridovirus,GSIV),有必要建立一种准确、快速、灵敏的检测方法,为疾病的诊断与防控提供技术手段,也为大鲵养殖业的健康发展提供技术保障。
环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术是Notomi等于2000年报道的一种新型等温核酸扩增方法(国际专利公开号WO00/28082),针对靶基因的6个位点设计4条LAMP引物,利用一种具有链置换活性的DNA聚合酶(Bst DNA聚合酶),在恒温条件下快速、高效、高特异、高灵敏地扩增靶序列,适合于现场和实验条件较简单的实验室进行快捷检测。引入一对环状引物的改进方法,进一步缩短了反应时间。
发明内容
本发明的一个目的是在于提供了一种大鲵虹彩病毒LAMP检测试剂盒,根据GenBank公布的GSIV毒株的MCP基因编码区序列(JN615141.1),应用PrimerExplorer V4(http://primerexplorer.jp/elamp4.0.0/index.html)在线软件设计特异性引物,利用LAMP技术扩增靶基因的特定区域,从分子水平对大鲵虹彩病毒进行快速检测,具有简便、快速、高特异性和灵敏性的特点。
本发明的另一个目的是在于提供了一种利用大鲵虹彩病毒LAMP检测试剂盒检测大鲵虹彩病毒的方法,本方法仅需一个水浴锅或金属浴即可在2小时内准确检测出样品中的GSIV,能检测GSIV感染的病鱼组织,能检测GSIV感染的细胞(例如EPC细胞),非常适用于GSIV的现场快速检测。
为了实现上述目的,本发明采用以下技术方案:
一种大鲵虹彩病毒LAMP检测试剂盒,包括以下成分:
该试剂盒包括以下成分:10×ThermoPol Reaction Buffer;Bst DNA聚合酶(NEB);dNTPs;外引物F3和B3、内引物FIP和BIP、Betaine(Sigma),MgCl2,1000×SYBR Green I(Invitrogen)。
F3:5,-CGACTTGGCCACTTATGACA-3,;
B3:5,-TTGACCTCGGGGGTCTTG-3,;
FIP:5,-GTGAACCACCCCACGGGGTAAAAACAATGTACGGGGGTTCAGAT-3,;
BIP:5,-AAGATGTCGGGTAACCCGGCTTAAAAACCAGGCGTTGAGGATGT-3,。
一种利用大鲵虹彩病毒LAMP检测试剂盒检测大鲵虹彩病毒的方法,其步骤是:
1、病毒DNA的获取:
采用试剂或Viral DNA Kit试剂盒等提取样本总DNA。
2、LAMP扩增:
采用25μl反应体系,包括:内引物FIP和BIP各0.8μM,外引物F3和B3各0.1μM,dNTPs1mM,Betaine0.5M,MgCl22-10mM,Bst DNA聚合酶8U,模板DNA5μl,10×ThermoPol Reaction Buffer2.5μl,余量去离子水补足。选择55-65℃的温度范围和30-120分钟的时间范围进行LAMP反应之后,80℃灭活2分钟。
3、检测结果判定,可用下述三种方法之一进行结果的判定:
1)发生扩增反应时,从dNTPs析出的焦磷酸根离子和反应液中的镁离子形成白色焦磷酸镁沉淀,通过肉眼判断:检测管出现明显浑浊为阳性,未见浑浊为阴性。
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