[发明专利]新噬菌体

说明书

发明领域

本发明涉及一种葡萄球菌噬菌体K突变体，其在野生型葡萄球菌噬菌体K(登录号：AY176327.1)的核苷酸序列的一个或多个选定区域内包含一个或多个突变，涉及所述噬菌体在治疗细菌性感染中的用途，涉及包含所述噬菌体的药物组合物并且涉及使用包含所述噬菌体的组合物治疗细菌性感染的方法。

背景技术

近年来，广泛使用基于化学的抗生素(如青霉素或四环素)形式的抗细菌剂已经导致抗生素耐药细菌菌株大幅度增加。赋予抗生素耐药性的突变或编码抗生素耐药性酶如青霉素酶的基因正在世界范围内在病原菌中变得日益常见。例如，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)(MRSA)细菌是一种日益常见形式的感染，经常在医院因其他原因而手术期间获得。MRSA感染是使用常规抗生素极端难以治疗的。

一种用抗生素治疗细菌性感染的替代性方案是用称作噬菌体的病毒感染细菌。这种“噬菌体治疗”首先在二十世纪早期开发，但是在二十世纪四十年代抗生素取得进展后在西方很少使用。

噬菌体对某些细菌细胞类型具有特异性。它们不能感染更复杂生物的细胞，原因在于关键胞内结构和细胞表面组分的差异。大部分噬菌体具有使它们与其靶细菌的表面上特定分子结合成为可能的结构物，如尾丝。病毒DNA(通常装在噬菌体头部内)或一些噬菌体中的RNA随后被注射(通常经尾部)至宿主细胞中。在严格裂解性噬菌体的情况下，使用宿主细胞的胞内机制，注射的病毒DNA/RNA继续指导噬菌体子代的产生。在细胞周期结束时，宿主细胞被裂解作用杀死。

葡萄球菌噬菌体K是多样性肌尾噬菌体科(Myoviridae)的成员。O'Flaherty S.等人(J.Bacteriol.(2004),186(9)2862-2871)的论文描述了携带118个推定性可读框(ORF)的葡萄球菌噬菌体K的DNA基因组的序列。噬菌体K先前已经表征为抗-MRSA噬菌体。O'Flaherty S.等人(Appl.Environ.Microbiol.(2005),71(4)1836-1842)在金黄色葡萄球菌的不同耐药性菌株上研究噬菌体K。

WO2009/044163描述一种抗细菌组合物，所述抗细菌组合物以足够高的浓度包含噬菌体K和/或噬菌体P68以便在不处于细菌中的情况下诱导裂解。

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)可以造成全身性感染或脓肿和溃疡，尤其在患病、年老或免疫受损的患者中。它日益成为院内死亡的主要原因或促成院内死亡。MRSA可以在无任何明显疾病症状的情况下定居在医生或来访者的鼻腔中。然而，这些细菌可以从人扩散至人，包括扩散至患者。因此，杀死细菌有助于预防本病。

医院目前利用醇类洗手液以帮助防止MRSA传播。然而，这类醇洗液经常不适用于敏感的鼻腔衬层或皮肤破损区域。因此，需要产生适于杀死细菌，如金黄色葡萄球菌和尤其MRSA的组合物。

本发明的目的是提供针对葡萄球菌菌株和尤其MRSA提供有效抗菌活性的替代性噬菌体。

发明概述

根据本发明的第一方面，提供一种葡萄球菌噬菌体K突变体，其在与野生型葡萄球菌噬菌体K(登录号：AY176327.1)的核苷酸序列相对应的以下一个或多个区域内包含一个或多个突变，所述区域选自：

a)ORF18和ORF19之间的区域；和/或

b)ORF41和ORF42之间的区域；和/或

c)ORF68；和/或

d)ORF86/88/90内的重叠区域；和/或

e)ORF92；和/或

f)ORF93；和/或

g)ORF96；和/或

h)ORF100。

根据本发明的又一个方面，提供如本文定义的用于治疗细菌性感染的噬菌体。

根据本发明的又一个方面，提供一种包含如本文定义的噬菌体及其可药用载体的药物组合物。

根据本发明的又一个方面提供治疗细菌性感染的方法，所述方法包括施用如本文定义的组合物至感染的表面。

附图简述

图1：显示实施例2中比较4种噬菌体(葡萄球菌噬菌体K、'Fred'、'Fred*'和'Fred*710')的DNA序列的简图。

图2：在噬菌体'Fred'的测序DNA中鉴定的可读框。方括号中的编号表示等同的葡萄球菌噬菌体K ORF。

发明详述