[发明专利]一种细胞类型的基因表达水平的测定

权利要求书

1.测量含有多个亚群的细胞混合物的第一亚群细胞中基因组表达的方法，所述方法包括：

确定多个亚群特征性基因，包括：

至少一个亚群靶基因；和

至少一个亚群参照基因，其相对于所述亚群靶基因具有更低的生物学变异，

所述多个亚群特征性基因中的每一个都被确定为这样的基因，其具有由所述第一亚群细胞提供的其转录本的占在所述细胞混合物中的至少的预定百分比，所述预定百分比等于或大于50%；

用计算机系统辅助测定所述细胞混合物中所述至少一个亚群靶基因的转录本的第一量和所述细胞混合物中所述至少一个亚群参照基因的转录本的第二量；和

计算参数，所述参数为所述第一量对所述第二量的相对值，所述参数代表了所述第一亚群中所述亚群靶基因的基因组表达量。

2.根据权利要求1所述的方法，其中测定所述第一量和所述第二量包括：

测量来自涉及所述细胞混合物的一个或多个反应的信号；和

使用所述信号测定所述第一量和所述第二量。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述一个或多个反应包括聚合酶链式反应(PCR)、微阵列或测序。

4.根据权利要求1所述的方法，还包括：

将所述参数与一个或多个临界值比较，以确定所述细胞混合物的分类。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述分类包括所述细胞混合物是处于病变状态还是非病变状态。

6.根据权利要求5所述的方法，其中一个范围区间值与非病变状态相关。

7.根据权利要求1所述的方法，其中确定所述第一亚群的多个亚群特征性基因包括：

接收关于所述第一亚群细胞中多个基因的表达的数据，以及关于一个或多个校准细胞混合物中多个基因的表达的数据；

基于所述数据，确定在所述第一亚群细胞中表达的第一组基因；

接收一个或多个校准细胞混合物中所述第一亚群细胞的比例细胞计数；和

分析所述数据以确定：

所述一个或多个校准细胞混合物中所述第一组基因中的每个基因的第一表达水平；和

所述第一亚群中所述第一组基因中每个基因各自的表达水平；和对于所述第一组基因中的每个基因：

使用所述比例细胞计数和所述各自的表达水平相对于所述第一表达水平，确定所述第一亚群是否提供了在所述一个或多个细胞混合物中各自基因的转录本的至少的所述预定百分比。