[发明专利]用于筛选肌酸转运蛋白缺陷的组合物和方法无效
| 申请号: | 201280034820.1 | 申请日: | 2012-05-25 |
| 公开(公告)号: | CN103857800A | 公开(公告)日: | 2014-06-11 |
| 发明(设计)人: | J·F·克拉克;G·派恩-盖特曼;黑泽裕子;K·张;W.张;M·凯迪达谢 | 申请(专利权)人: | 辛辛那提大学;辛辛那提儿童医院医疗中心技术商业化中心 |
| 主分类号: | C12P19/34 | 分类号: | C12P19/34;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 孙式洪 |
| 地址: | 美国*** | 国省代码: | 美国;US |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 筛选 转运 蛋白 缺陷 组合 方法 | ||
1.一种用于鉴定受试者中的SLC6A8肌酸转运蛋白基因突变的筛选方法,所述方法包括:
(a)在扩增条件下用多个聚合酶链反应(PCR)扩增引物对处理来自人的基因组DNA样品,所述扩增引物对用于扩增多个包含SLC6A8的人基因组DNA区域,其中:
第一对扩增引物扩增SLC6A8的第一个区域,
第二对扩增引物扩增SLC6A8的第二个区域,
第三对扩增引物扩增SLC6A8的第三个区域,
所述处理产生含有SLC6A8的第一个区域的第一种扩增产物,含有SLC6A8的第二个区域的第二种扩增产物,和含有SLC6A8的第三个区域的第三种扩增产物,
(b)用第一组测序引物对测序所述第一种扩增产物,用第二组测序引物对测序所述第二种扩增产物,和用第三组测序引物对测序所述第三种扩增产物,其中比对来自所述第一种、第二种和第三种扩增产物的序列,以提供样品中的SLC6A8的DNA序列,和
(c)比较SLC6A8的DNA序列与SLC6A8的参考DNA序列,从而鉴定所述突变。
2.权利要求1的方法,其中所述第一对扩增引物包含SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2。
3.权利要求1的方法,其中所述第二对扩增引物包含SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4。
4.权利要求1的方法,其中所述第三对扩增引物包含SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:12。
5.权利要求1的方法,其中所述SLC6A8的第一个区域包含外显子1,所述SLC6A8的第二个区域包含外显子2-4,并且所述SLC6A8的第三个区域包含外显子4-13。
6.权利要求1的方法,其中所述第一个区域含有SLC6A8的核苷酸位置1-25至c.262+25,所述第二个区域含有SLC6A8的核苷酸位置c.263-25至c.777+25,并且所述第三个区域含有SLC6A8的核苷酸位置c.645-25至c.1908+25。
7.权利要求1的方法,其中所述第一组测序引物对包含SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2。
8.权利要求1的方法,其中所述第二组测序引物对包含SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8、以及SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10。
9.权利要求1的方法,其中所述第三组测序引物对包含SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18和SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20和SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:20和SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:20和SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24和SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:28、以及SEQ ID NO:29和SEQ ID NO:30。
10.权利要求1的方法,其中所述样品得自所述受试者的血液。
11.权利要求1的方法,其进一步包括评估受试者中的肌酸转运蛋白蛋白质的功能。
12.权利要求11的方法,其中所述评估包括测定肌酸转运蛋白动力学包含Km和Vmax。
13.权利要求11的方法,其中所述评估包括对来自所述受试者的生物样品执行肌酸转运蛋白测定法。
14.权利要求1的方法,其中当SLC6A8的DNA序列包含指示肌酸转运蛋白缺陷的诊断的至少一个突变,所述方法进一步包括:
评估所述受试者中的肌酸转运蛋白蛋白质的功能;和
使所述肌酸转运蛋白蛋白质的功能与指示肌酸转运蛋白缺陷的诊断的至少一个突变关联。
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