[发明专利]KRAS突变和肿瘤生物学

权利要求书

1.一种用于识别具有使雌激素受体(ER)和孕激素受体(PR)阴性(ER／PR阴性)发展为乳腺癌风险的主体或患者的方法，包括检测在患者样本中人KRAS的let-7互补位LCS6中的突变，其中所述突变是一种包括在LCS6位点4处的尿嘧啶(U)或胸腺嘧啶(T)转变为鸟嘌呤(G)的单核苷酸多态性(SNP)，其中所述突变的存在表明具有将ER／PR阴性发展为乳腺癌的增加风险。

2.一种用于在有发展为乳腺癌风险的主体或患者中预测雌激素受体(ER)和孕激素受体(PR)阴性(ER／PR阴性)发展为乳腺癌的发病的方法，包括检测患者样本中人KRAS的let-7互补位LCS6中的突变，其中所述突变是一种包括LCS6位点4处的尿嘧啶(U)或胸腺嘧啶(T)转变为鸟嘌呤(G)的单核苷酸多态性(SNP)，其中所述突变的存在表明具有将ER／PR阴性发展为乳腺癌的更早发病。

3.根据权利要求2所述的方法，其中ER／PR阴性乳腺癌也是HER2阴性，从而其是一种三阴性乳腺癌(TNBC)。

4.根据权利要求3所述的方法，其中三阴性乳腺癌(TNBC)是一种基底肿瘤或luminal型肿瘤。

5.根据权利要求4所述的方法，其中三阴性乳腺癌(TNBC)是一种基底肿瘤，其表达一种转录子或者表皮生长因子受体(EGFR)或细胞角蛋白5／6(CK5／6)基因编码的蛋白质。

6.根据权利要求1、2、或3所述的方法，其中乳腺癌的进一步特征在于低表达或阴性表达的乳腺癌1(BRCA1)基因。

7.根据权利要求1、2、或3所述的方法，其中主体或患者是绝经前女性。

8.根据权利要求1、2、或3所述的方法，其中主体或患者的年龄是51岁或更年轻。

9.一种对患有卵巢上皮癌(EOC)的主体或患者进行预测的方法，包括检测患者样本中人KRAS的let-7互补位LCS6中的突变，其中所述突变是一种包括在LCS6位点4的尿嘧啶(U)或胸腺嘧啶(T)转变为鸟嘌呤(G)的单核苷酸多态性(SNP)，其中，当与对照组对比时，突变的存在表明存活率降低。

10.根据权利要求9所述的方法，其中主体或患者为绝经后、52岁或至少52岁。

11.根据权利要求9所述的方法，其中对照组不携带突变。

12.根据权利要求1所述的方法，其中生存率是总的生存率、五年的生存率或一年的生存率。

13.一种对卵巢上皮性癌(EOC)细胞铂类化疗响应进行预测的方法，包括检测患者样本中人KRAS的let-7互补位LCS6中的突变，其中所述突变是一种包括在LCS6位点4的尿嘧啶(U)或胸腺嘧啶(T)转变为鸟嘌呤(G)的单核苷酸多态性(SNP)，其中所述突变的存在表明铂类化疗耐药性。

14.根据权利要求13所述的方法，其中卵巢上皮性癌细胞在体外或离体评价。

15.根据权利要求14所述的方法，其中主体是绝经后、52岁或至少52岁，主体卵巢上皮性癌细胞离体评价。

16.根据权利要求14所述的方法，其中卵巢上皮性癌细胞在体外进行评估，其中卵巢上皮性癌细胞被分离、复制，或来自BG1、CAOV3、或IGR-OV1细胞株。

17.根据权利要求13所述的方法，其中铂类化疗是卡铂或紫杉醇。

18.根据权利要求13所述的方法，其中铂类化疗是辅助治疗。

19.一种患有大肠癌(CRC)的测试主体预测的方法，包括检测患者样本中人KRAS基因let-7互补位LCS6突变，其中所述突变是一种包括在LCS6位点4的尿嘧啶(U)或胸腺嘧啶(T)转变为鸟嘌呤(G)的单核苷酸多态性(SNP)，其中所述突变的存在显示存活率增加。

20.根据权利要求19所述的方法，其中检测步骤进一步包括微卫星不稳定性(MSI)分析

21.根据权利要求19所述的方法，其中大肠癌(CRC)是早期阶段大肠癌。

22.根据权利要求19所述的方法，其中大肠癌(CRC)是1期或2期大肠癌。