[发明专利]生成用于对样本进行切片的切片方案

说明书

技术领域

本发明涉及生成用于对样本进行切片（slicing）的切片方案。

背景技术

尽管大多数癌症是通过临床和放射学检查来探测的，病理学是用于包括乳腺癌的不同类型癌症的诊断的金标准。

尤其在病变较小时，病理检查的准确性取决于对样本的合适制备和切片。在乳腺癌中，在高比例的早期探测到的癌症，例如，导管原位癌（DCIS）的情况下，其中病变通常较小，尤其是这样。由于所述早期探测到的癌症不提供触觉反馈，并且对病理学医师来说是不可见的，样本必须进行仔细取样，以使漏诊癌症的数目最小化。

病理学医师一般需要大量来自组织样本的组织学制备剖面（section）。使用显微摄影来拍摄这些剖面。能够通过外科手术或活组织检查（其中，从身体移除组织样品），获得所述样本。

组织学切片通常表示选定提供用于（例如通过确定病理病变的类型及其范围）诊断和处置监测的信息的公用的剖面集合。该组剖面通过以下切片方案产生，并且例如包括沿样本的长轴的至少一个剖面、在贯穿所述长轴的所述组织样本的每侧上的至少一到两个剖面以及来自所述病变中心的至少三到四个剖面。切片的数目通常随着所述病变的尺寸而增加。例如在Ackerman’s Surgical Pathology（阿克曼外科病理学）第八版（1996年）的附录H中，给出了制备组织学剖面的描述。

WO98/36682公开了一种用于便于对组织中的病变进行病理检查的系统，其中，使用共焦光学器件对所述病变进行光学扫描，以生成表示病变显微剖面的共焦图像，用于提供传统上对病理学医师而言能够通过在显微镜下观察病变的一组组织学制备剖面的玻片来获取的信息。此外，所引用的文件公开了这种共焦图像的存储，以及它们从一个位置向在远程位置的病理学医师的传送，以获得对所述共焦图像的解读。

发明内容

具有一种用于便于对样本进行病理检查的改进的系统，将是有利的。为了更好地解决该问题，本发明的第一个方面提供一种用于生成对样本进行切片的切片方案的系统，所述系统包括：

参数单元，其用于基于表示至少部分所述样本的图像数据集，确定所述样本中的病变的至少一个参数；以及

切片方案单元，其用于基于所述至少一个参数，确定用于所述样本的病理检查的切片方案。

该系统分析样本，并且基于所述样本中的所述病变的参数，确定用于病理检查的切片方案。这样，使得对样本的切片更具可重复性。不再需要猜测如何对所述样本进行切片。由于所述切片方案是基于所述病变的参数的，可以更好地调整所述切片以适应特定的样本；因此，减小了由于次优的切片方案而漏诊所述病变的重要方面的机会。

所述系统可以包括样本制备单元，其用于基于所述图像数据集，确定切片制备协议，其中，所述切片制备协议包括涉及所述样本并且将在对所述样本进行切片之前应用的制备步骤的表示。这有助于以可重复的方式自动地确定所述切片制备协议。

所述系统可以包括分割单元，其用于分割所述图像数据集中的所述病变，其中，所述参数单元被布置为基于经分割的病变，确定所述至少一个参数。对所述病变的所述分割提供了用于确定所述参数的有用的预处理步骤，尤其在所述参数包括所述病变的几何参数时。

可以由所述参数单元确定以下参数中的至少一个：所述病变在所述样本中的位置、取向以及范围。例如，可以相对于所述样本的外边界确定这些参数。备选地或额外地，可以相对于所述样本中的一个或多个标记物确定所述参数。例如，可以在所述样本中提供在所述图像数据集中可见的线（wires）。

所述系统可以包括标记物探测器，其用于探测所述图像数据集中的至少一个标记物，并且其中，所述切片方案单元被布置为关于所述至少一个标记物表达所述切片方案。不仅可以相对于所述标记物表达所述参数，而且还可以相对于所述切片方案自身表达所述参数。由于所述标记物提供了可靠的参考位置，这使得更容易执行所述切片。

所述系统可以包括显示单元，其用于显示所述切片方案。这样，可以由能够参考显示的切片方案的人执行所述切片，以根据显示的切片方案执行实际切片。

所述显示单元可以被布置为显示所述切片方案的文本表示。该文本表示可以是表达所述切片方案的有效方式。

所述显示单元可以被布置为显示图形表示，所述图形表示示出相对于所述样本和/或所述病变的所述切片方案。这使得有可能容易地考察所述切片方案是否充分覆盖所述病变。