[发明专利]旋转依赖性转录测序系统及使用方法

权利要求书

1.一种测定靶核酸分子序列的方法，其包括：

提供固定化有RNA聚合酶的固体基片；

在第一测序条件下使所述RNA聚合酶与所述靶核酸分子接触，其中所述靶核酸分子包含旋转标签，其中所述第一测序条件包括四种核苷三磷酸的存在，其中所述四种核苷三磷酸的第一核苷三磷酸以速率限制量存在；

在所述第一测序条件下检测所述旋转标签的旋转方式；并

基于所述旋转方式的变化沿着所述靶核酸分子测定所述第一核苷三磷酸的位置信息。

2.权利要求1的方法，其中所述固体基片是玻璃。

3.权利要求1的方法，其中所述RNA聚合酶是噬菌体RNA聚合酶。

4.权利要求3的方法，其中所述噬菌体RNA聚合酶是T7RNA聚合酶。

5.权利要求3的方法，其中所述噬菌体RNA聚合酶是T3RNA聚合酶。

6.权利要求1的方法，其中所述RNA聚合酶是细菌RNA聚合酶。

7.权利要求6的方法，其中是细菌RNA聚合酶是大肠杆菌RNA聚合酶。

8.权利要求1的方法，其中经由His标签在所述固体表面上固定化所述RNA聚合酶。

9.权利要求1的方法，其中所述靶核酸分子是真核的。

10.权利要求1的方法，其中所述靶核酸分子是双链的。

11.权利要求1的方法，其中所述靶核酸分子包含于生物学样品内。

12.权利要求1的方法，其中所述靶核酸分子包含RNA聚合酶启动子序列。

13.权利要求1的方法，其中所述旋转标签包含第一标签和第二标签。

14.权利要求1的方法，其中所述第一标签是磁性的。

15.权利要求1的方法，其中所述检测步骤包括将光投射至所述旋转标签上。

16.权利要求15的方法，其中所述检测步骤进一步包括经由显微镜观察所述旋转方式。

17.权利要求1的方法，其中所述检测步骤进一步包括在CMOS或CCD上捕获所述旋转方式。

18.权利要求1的方法，其中所述固体基片是CMOS或CCD。

19.权利要求1的方法，其中所述检测步骤包括以磁像捕获所述旋转方式。

20.权利要求19的方法，其中在GMR传感器或MRAM阵列上捕获所述磁像。

21.权利要求1的方法，其中所述检测步骤包括以电场捕获所述旋转方式。

22.权利要求21的方法，其中在RAM传感器上捕获所述图像。

23.权利要求1的方法，其进一步包括对所述靶核酸分子应用定向力。

24.权利要求23的方法，其中用磁体产生所述定向力。

25.权利要求23的方法，其中用流或压力产生所述定向力。

26.权利要求1的方法，其进一步包括：

提供固定化有RNA聚合酶的固体基片；

在第二测序条件下使所述RNA聚合酶与包含所述旋转标签的所述靶核酸分子接触，其中所述第二测序条件包括四种核苷三磷酸的存在，其中所述四种核苷三磷酸的第二核苷三磷酸以速率限制量存在；

在所述第二测序条件下检测所述旋转标签的旋转方式；并

基于所述旋转方式的变化沿着所述靶核酸分子测定所述第二核苷三磷酸的位置信息。

27.权利要求26的方法，其中与在所述第一测序条件下的所述接触和检测步骤同时实施所述第二测序条件下的所述接触和检测步骤。

28.权利要求26的方法，其中在所述第一测序条件下的所述接触和检测步骤之前或之后序贯实施所述第二测序条件中的所述接触和检测步骤。