[发明专利]用于蛋白熔解曲线数据分析的系统和方法有效
申请号: | 201280015278.5 | 申请日: | 2012-02-01 |
公开(公告)号: | CN103688264B | 公开(公告)日: | 2017-09-15 |
发明(设计)人: | 奈弗蒂塔·马朱木达尔;哈里森·梁;吴若云 | 申请(专利权)人: | 生命技术公司 |
主分类号: | G06F19/26 | 分类号: | G06F19/26 |
代理公司: | 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司11204 | 代理人: | 王达佐,洪欣 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 蛋白 熔解 曲线 数据 分析 系统 方法 | ||
相关申请的交叉引用:
本申请要求于2011年2月1日提交的美国临时专利申请第61/438621号、于2011年3月8日提交的美国临时专利申请第61/450306号和于2011年6月14日提交的美国临时专利申请第61/496980号的优先权,所述申请全部在此通过引用并入本文中。
背景
正如蛋白化学领域中的技术人员可获悉的,蛋白熔解曲线数据可发生很大的变化,并且可在多种分析属性上展现出可变性。此类分析属性可包括,例如但不限于曲线形状、背景信号、信号幅度的变化以及噪声。
用于蛋白熔解曲线数据分析的本教导的系统和方法(其中可确定熔解温度(Tm)),满足了客观且一致地分析蛋白熔解曲线数据的需要。对于蛋白熔解曲线数据,例如在高通量分析中,可处理多个蛋白样品,这可产生一组蛋白熔解曲线数据,其在一系列分析属性上展现出高可变性。
同时处理的多个样品的组合,连同数据的复杂性,产生了以容易帮助最终用户评价数据的方式处理数据的需要。
附图简述
图1的框图说明了示例性计算机系统的元件,所述计算机系统可应用于用于处理熔解曲线分析的蛋白样品的系统的控制和连接中。
图2为可用于熔解曲线分析的蛋白样品的处理的一些仪器特征的实例的框图。
图3为用于分析熔解曲线数据的交互式GUI的多个实施方案的输入示意图/输出示意图。
图4的流程图描述了用于分析蛋白熔解曲线数据的系统和方法的多个实施方案。
图5的流程图描述了用于分析蛋白熔解曲线数据的系统和方法的多个实施方案。
图6的流程图描述了用于分析蛋白熔解曲线数据的系统和方法的多个实施方案。
图7的图示说明了用于多相蛋白熔解的峰选择的方法的多个实施方案。
图8的图示说明了用于多相蛋白熔解的峰选择的方法的多个实施方案。
图9为根据本教导中系统和方法的多个实施方案的交互式GUI的示例性窗口。
图10A和图10B为图9的GUI的实施方案的示例性部分,其显示了示例性弹出窗口的功能选择的作用。
图11为根据本教导中系统和方法的多个实施方案的交互式GUI的示例性窗口。
图12为图9的交互式GUI的实施方案的示例性部分,其显示了最终用户比较熔解温度(Tm)确定的多个实施方案的交互性质。
图13为图9的交互式GUI的实施方案的示例性部分,其显示了最终用户选择用于分析熔解温度(Tm)确定的多个实施方案的目标温度区域的交互性质。
图14为图9的交互式GUI的实施方案的示例性部分,其显示了用于观察熔解温度(Tm)确定的多个实施方案的选择数据的数据的拟合的设施。
图15为本教导中交互式GUI的实施方案的示例性部分,其显示了用于观察显示多相熔解的数据的拟合的设施。
图16为图14的交互式GUI的实施方案的示例性部分,其显示了用于观察显示多相的数据的拟合的设施。
图17A和图17B显示了根据提供蛋白熔解分析的系统的多个实施方案的交互式GUI的特征,其显示了用于观察曲线与共有y轴对齐的多条曲线的设施。
图18为显示了用于传送重复数据组相关信息的本教导中的多个实施方案的交互式GUI的特征。
图19的图表描述了根据本教导中交互式GUI的系统和方法的多个实施方案,其描述了最终用户可接收的标志通知的多种条件图20描述了根据提供蛋白熔解分析的系统的多个实施方案的交互式GUI的特征的示例性部分,其显示了用于观察多种参数对重复数据组的影响的设施。
图21描述了根据提供蛋白熔解分析的系统的多个实施方案的交互式GUI的特征的示例性部分,其显示了经由示例性弹出窗口的选择用于观察多种参数对重复数据组的影响的设施。
图22是图19的交互式GUI的实施方案的示例性部分,其显示了用于观察多种参数对重复数据组的影响的设施。
图23是图19的交互式GUI的实施方案的示例性部分,其显示了用于观察多种参数对重复数据组的影响的设施。
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