[发明专利]结肠直肠癌复发的预后特征

权利要求书

1.一种用于预测患者中的结肠直肠癌复发和/或不复发的分析系统，所述分析系统适合用于对患者样本的预后基因谱的定量表达进行分析，所述预后基因谱与结肠直肠癌复发相关，所述谱包括SEQ ID NOS：1、2、3、4和5的核酸序列的表达。

2.根据权利要求1所述的分析系统，所述系统适合用于分析SEQ ID NOS：1、2、3、4和5的核酸序列的定量表达。

3.根据权利要求1所述的分析系统，所述系统还适合用于定量分析SEQ ID NOS：6至23中的至少一个核酸序列的表达。

4.一种装置，所述装置包括权利要求1所述的分析系统。

5.一种用于预测患者中的结肠直肠癌复发和/或不复发的分析系统，所述分析系统包括：计算机软件，所述计算机软件被设计用于将从患者的样本获得的基因表达数据应用于预后规则：如果[(((SEQ ID NO 1/SEQ ID NO 3)X SEQ ID NO 5)-((SEQ ID NO 2/SEQ ID NO 4)X SEQ ID NO 3))≥-4.4777]，那么复发。

6.一种装置，所述装置包括权利要求5所述的分析系统。

7.一种装置，所述装置包括权利要求6所述的分析系统和权利要求5所述的分析系统。

8.一种用于预测患者中的结肠直肠癌复发和/或不复发的分析系统，所述分析系统包括：计算机软件，所述计算机软件被设计用于将从患者的样本获得的基因表达数据应用于预后规则：如果规则使用SEQ IDS1-23，那么复发。

9.一种装置或试剂盒，包括：

a）经分离和纯化的多核苷酸，所述多核苷酸至少代表SEQ ID NOS：1、2、3、4和5中每一个核酸序列的编码序列；

b）SEQ ID NOS：1、2、3、4和5中每一个核酸序列的经分离的RNA、cDNA、或gDNA分子；

c）a）或b）的互补物或部分；

d）设计用于扩增a）、b）或c）的扩增探针；或者

e）设计用于分析a）、b）或c）的表达的杂交探针；并且

其中，所述装置或试剂盒适合用于测定结肠直肠癌复发的风险。

10.一种基质，所述基质包含探针，所述探针适合用于预后结肠直肠癌基因谱的表达的定量分析，所述基因谱包含SEQ ID NOS：1、2、3、4和5的核酸序列。

11.一种结肠直肠癌预后核酸微阵列，所述微阵列包括权利要求10所述的基质。

12.一种用于预测患者中的结肠直肠癌复发风险的方法，所述方法包括：

a）向权利要求5所述的分析系统提供患者的预后结肠直肠癌基因谱中每一个基因的确定的表达水平，所述基因谱含有SEQ ID NOS：1、2、3、4和5的核酸序列；

b）将患者的确定的基因表达水平应用于分析系统中的规则；和

c）如果应用于规则的患者的基因表达水平的分析结果大于或等于-4.4777，则预测患者结肠直肠癌复发的风险相对较高。

13.一种用于预测患者中的结肠直肠癌复发和/或不复发的分析系统，所述分析系统包括：计算机软件，所述计算机软件被设计用于将从患者的样本获得的定量基因表达数据应用于预后规则，所述预后规则得自结肠直肠癌预后基因谱，所述预后基因谱由SEQ ID NOS：1、2、3、4和5的核酸序列的全部或子集组成。

14.一种用于预测患者中的结肠直肠癌复发风险的方法，所述方法包括：

a）向权利要求13所述的分析系统提供患者的预后结肠直肠癌基因谱中每一个基因的确定的表达水平，所述基因谱含有SEQ ID NOS：1、2、3、4和5或者衍生规则的子集的核酸序列；

b）将患者的确定的基因表达水平应用于分析系统中的规则；和

c）如果应用于规则的患者的基因表达水平的分析结果大于或等于-4.4777，则预测患者结肠直肠癌复发的风险相对较高。

15.一种用于预测患者中的结肠直肠癌复发和/或不复发的分析系统，所述系统适合用于对患者样本的预后基因谱的定量表达进行分析，所述预后基因谱与结肠直肠癌复发相关，所述谱包括SEQ ID NOS：1、2、3、4、5、6、7、8、10、14、18和19的核酸序列的表达。