[发明专利]基于基因芯片数据和代谢网络测定癌症关键代谢酶的方法有效
申请号: | 201210588060.0 | 申请日: | 2012-12-30 |
公开(公告)号: | CN103902849B | 公开(公告)日: | 2017-03-29 |
发明(设计)人: | 田卫东;陈靖琪 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
主分类号: | G06F19/10 | 分类号: | G06F19/10 |
代理公司: | 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙)31268 | 代理人: | 吴桂琴 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 基因芯片 数据 代谢 网络 测定 癌症 关键 方法 | ||
技术领域
本发明属医学技术领域,涉及癌症关键代谢酶及候选药物靶点,具体涉及一种基于基因芯片数据和代谢网络测定癌症关键代谢酶的方法,尤其涉及寻找癌症关键代谢酶以作为候选药物治疗靶点的方法(Met-express);本方法可有效地预测癌症中处于关键地位可能可重调代谢过程的酶以为药物开发提供候选靶点。
背景技术
近几十年来,癌症诊断和治疗领域取得了若干的进展,然而,目前癌症仍然是危及人类健康和寿命的最严重疾病之一;为了减少病痛及由癌症引起的死亡,癌症相关领域的研究仍引起有关研究人员的密切关注。其中,在癌症的致病机理研究中,很多关于癌症的高通量实验数据被发布在公共数据库中,例如,GEO数据库中的基因表达芯片数据数量庞大,通常有助于各实验特定的研究目的,其中的大量信息可被跨实验综合利用。
现有技术公开了,在癌细胞中有许多代谢通路被重调以适应癌症的特定需求或促进癌症的发生发展;有研究通过计算方法挖掘整合公共数据库中的高通量数据以研究癌细胞相对的代谢变化,寻找居于核心地位的酶,以期通过影响这些酶的表达来影响癌细胞代谢过程,进而起到治疗癌症的作用。
关于对大规模数据的处理,本领域公知,其中除了依赖于数据的质量,还依赖于适宜的计算方法;由于计算模拟方法具有易操作性,通过计算机模拟进行癌症代谢特征分析并预测候选靶点可以为下一步大规模实验验证节约大量的时间和经费。目前,迫切需要一种可以通过大规模数据预测癌症治疗靶点的计算方法,为癌症的治疗方案的设计提供新的可能性。
与本发明有关的参考文献:
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2.Ruan J,Dean AK,Zhang W:A general co-expression network-based approach to gene expression analysis:comparison and applications.BMC systems biology 2010,4(1):8.
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