[发明专利]一种用于鉴定云南元江普通野生稻细胞质雄性不育系的恢复系的分子标记及专用引物

说明书

技术领域

本发明涉及一种用于鉴定云南元江普通野生稻细胞质雄性不育系的恢复系的分子标记及专用引物。

背景技术

水稻是世界上最主要的粮食作物之一，提高水稻单产是保障世界粮食安全的有力措施之一。在作物长期的进化过程中，由于育种家根据需要选择目标性状并对其进行定向培育及亲本的重复使用，使得品种遗传基础狭窄。目前，约占水稻种植面积的一半以上的杂交水稻，所使用的杂交组合95%以上是由野败型或与野败型相类似的细胞质雄性不育系组配而成的,长期使用单一来源细胞质,可能出现遗传脆弱性的危险。

野生稻既是研究稻作起源、分类、演化的重要实物依据，又是栽培稻育种的宝贵种质资源。野生稻也是天然的基因库，保存有栽培稻没有或已消失了的遗传基因，并具有特殊优良农艺性状，如雄性不育性、高产、优质、抗逆性等。由于所处生态环境的复杂性在其漫长的进化过程中，形成了极其丰富的遗传多样性。Sun et al（2001）研究发现在检测的44个RFLP位点中，栽培稻的等位基因数约为野生稻的60%，并提出：野生稻在演化成栽培稻的过程中，等位基因减少，基因多样性下降，一些基因已在栽培稻中丢失（Sun C Q，Wang X K，LiZ C，Yoshimura A.Comparison of the genetic diversity of common wild rice(Oryza rufipogon Griff.)and cultivated rice (O.sativaL.)using RFLP markers.Theor Appl Genet，2001，102:157-162）。因此，研究如何从野生稻中挖掘优异基因，并把它们应用于栽培稻育种生产，具有十分重要的理论意义和实践价值。

植物的胞质雄性不育现象，在生产上作为一种遗传育种工具，在农作物杂种优势利用过程中省去人工去雄的麻烦，确保了杂交种子的纯度，具有巨大的生产价值。在天然的植物中，普遍存在细胞质雄性不育，这是植物系统进化趋势的必然产物，而且在自然条件下，恢复基因总是与细胞质雄性不育相伴随，这是不育细胞质在群体中保存和传递的前提，这种核质互作的恢保关系具有专一性，这也是细胞质雄性不育分类及发现新的细胞质雄性不育类型的主要依据。我国杂交稻生产中应用的雄性不育细胞质主要来源于普通野生稻，可以推测野生稻中也必然存在相应的恢复基因（李绍清等，2005），但用于生产上的恢复基因来源于野生稻的却很少。本研究利用可育的元江普通野生稻与93-11构建的高代回交群体，发现元江野生稻的细胞质中存在不育基因，细胞核存在恢复基因，该不育细胞质及其恢复基因的发现与定位，对丰富三系杂交稻不育细胞质和恢复基因的遗传多样性具有重要的理论意义和实用价值。

发明内容

本发明的一个目的是提供一种用于辅助鉴别云南元江普通野生稻细胞质雄性不育系的恢复系的方法及其专用分子标记和专用引物。

本发明所提供的用于辅助鉴别云南元江普通野生稻细胞质雄性不育系的恢复系的引物对，一个引物的核苷酸序列如序列表中序列1所示，另一个引物的核苷酸序列如序列表中序列2所示。

本发明所提供的用于辅助鉴别云南元江普通野生稻细胞质雄性不育系的恢复系的分子标记，是用上述引物对PCR扩增云南元江普通野生稻得到的PCR产物。

本发明所提供的辅助鉴别云南元江普通野生稻细胞质雄性不育系的恢复系的方法，包括如下步骤：分别以云南元江普通野生稻和待测水稻品种的基因组DNA为模板，用上述引物对进行PCR扩增，若所述待测水稻品种的PCR扩增产物大小与所述云南元江普通野生稻的PCR扩增产物大小一致，则所述待测水稻品种候选为云南元江普通野生稻细胞质雄性不育系的恢复系。

上述方法中，所述PCR扩增产物大小可以通过琼脂糖凝胶电泳检测确定。

上述方法中，通过琼脂糖凝胶电泳检测确定的PCR扩增产物大小为100bp。

上述引物对、上述分子标记、上述方法中，所述云南元江普通野生稻细胞质雄性不育系是以栽培稻93-11为遗传背景、以云南元江普通野生稻为供体、高代回交得到的。

具体的，上述云南元江普通野生稻细胞质雄性不育系是指“水稻的一个野栽渗入系的名称命名为元9A”。