[发明专利]唐氏综合征21号染色体相关miRNA、基因、筛选方法和应用无效
| 申请号: | 201210555209.5 | 申请日: | 2012-12-20 |
| 公开(公告)号: | CN103045596A | 公开(公告)日: | 2013-04-17 |
| 发明(设计)人: | 徐勇;李武县;戴勇 | 申请(专利权)人: | 徐勇 |
| 主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12Q1/68;C12N15/10 |
| 代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 何平 |
| 地址: | 518118 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 综合征 21 染色体 相关 mirna 基因 筛选 方法 应用 | ||
1.一种与唐氏综合征21号染色体相关的miRNA基因,具有如SEQ ID NO.1的核苷酸序列。
2.如权利要求1所述的miRNA基因在制备诊断或检测唐氏综合征试剂中的应用。
3.如权利要求1所述的miRNA基因在制备诊断或检测唐氏综合征基因检测芯片中的应用。
4.一种与唐氏综合征21号染色体相关的miRNA的前体,具有如SEQ IDNO.2的核苷酸序列。
5.如权利要求1所述的miRNA的前体在制备诊断或检测唐氏综合征试剂中的应用。
6.如权利要求1所述的miRNA的前体在制备诊断或检测唐氏综合征试剂中的应用。
7.一种与唐氏综合征21号染色体相关的miRNA,具有如SEQ ID NO.3的核苷酸序列。
8.如权利要求1所述的miRNA在制备诊断或检测唐氏综合征试剂中的应用。
9.如权利要求1所述的miRNA在制备诊断或检测唐氏综合征基因检测芯片中的应用。
10.一种唐氏综合征21号染色体相关miRNA的筛选方法,其特征在于,包括如下步骤:
分别采集唐氏综合征胎儿和正常胎儿的脐带血单个核细胞样品;
提取所述样品中的总RNA,用变性聚丙烯胺凝胶电泳分离回收长度不大于30个核苷酸的小RNA,在T4RNA连接酶的作用下,在回收的小RNA的5’端加上如SEQ ID NO.4的核苷酸序列接头,3’端加上如SEQ ID NO.5的核苷酸序列接头,经TBE聚丙烯胺凝胶电泳纯化后,经Solexa小RNA反转录引物和PCR扩增后制成小RNA的cDNA文库,再使用TBE聚丙烯胺凝胶电泳对所述cDNA文库进行纯化并进行测序分析;
对测序后所得的小RNA分子进行去接头和去污染处理,并从中筛选出长度为18~30nt的核苷酸序列,用SOAP软件将所得序列与人全基因组序列进行比对分析,将匹配上的序列按照GenBank>Rfam>miRBase17.0>repeat>exon>intron的优先级顺序进行分类注释,然后将intron和未比对上序列的小RNA分子序列作为新miRNA的数据源,用MIREAP和MiPred两种软件对所述新miRNA所在的染色体进行分析,得到所述唐氏综合征21号染色体相关miRNA。
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